宋亚兵
- 作品数：4 被引量：49H指数：3
- 供职机构：华南农业大学兽医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 猪传染性胃肠炎病毒SY株的分离鉴定及S基因的序列分析被引量：8
- 2016年
- 取沈阳地区某猪场表现为腹泻症状的病死仔猪小肠病料,无菌处理后接种在PK-15细胞上分离病毒。通过无限稀释法进行病毒纯化、病毒中和试验和RT-PCR检测,证实其为传染性胃肠炎病毒（TGEV）,并命名为TGEV SY株。参照Gen Bank中TGEV序列设计引物,对SY株S基因进行RT-PCR扩增,克隆并测序,获得S基因组完全序列。将S基因序列和所编码的氨基酸序列与Gen Bank中登录的10个TGEV和1个PRCV S基因序列进行同源性和亲缘关系的比较分析。结果表明,SY株S基因核苷酸序列和编码的氨基酸序列与其他参考毒株的同源性分别为96.4%-99.2%和96.0%-97.9%;而与PRCV毒株的同源性分别为96.2%和96.6%。由系统进化树可知,SY株与国内的华毒株、TS株以及国外的Miller M60株位于进化树的同一分支,亲缘关系较近。总体来看,各毒株之间的S基因差异性不大,表明TGEV虽然处于不断遗传演化中,但不同毒株的S基因变异不是特别明显。
- 尤刘阳苏丹萍宋亚兵王飞陈小芬贺东生
- 关键词：猪传染性胃肠炎病毒
- 2014—2015年我国部分省份猪流行性腹泻病毒S基因的遗传变异分析被引量：23
- 2016年
- 2010年以来,猪流行性腹泻肆虐我国的养猪业,给养猪业造成了严重的经济损失。为分析PEDV在我国最新的遗传变异情况,本试验对2014—2015年在7个省份分离的9株PEDV毒株的S基因进行克隆和测序,并将其分别与疫苗株、中国2010年前经典毒株、中国2010—2013年出现的毒株及韩国、美国近年来毒株进行S基因序列比对、分析。结果发现：9株PEDV S基因核苷酸同源性为98.4%~99.5%;与疫苗株和中国2010年前经典毒株相比核苷酸同源性为93.4%~96.2%;与中国、韩国、美国近年来暴发的毒株相比核苷酸同源性为97.4%~99.2%。遗传进化树显示：我国常用的疫苗毒株CV777处于G1组,这9株毒株S基因均位于G2组,说明我国当前流行毒株与疫苗株和早期经典毒株的亲缘性相去较远。序列比对表明现阶段PEDV S基因已发生较大变异,存在高度相似的缺失,插入和变异,且在中和表位区域存在多处变异,可能降低常规疫苗的免疫保护作用。
- 王飞陈小芬苏丹萍宋亚兵焦臣鹏陈瑞爱贺东生
- 关键词：猪流行性腹泻S基因
- 2012年～2016年广东省猪丁型冠状病毒的流行病学调查及分析被引量：18
- 2018年
- 为调查广东省猪丁型冠状病毒(PDCoV)的流行情况,本研究对2012年～2016年采集的420份猪腹泻病料样品进行RT-PCR检测,并对其中一株PDCoV(PDCoV/CHGD/2016)进行全基因组扩增、测序及遗传进化分析。RT-PCR检测结果显示,PDCoV的阳性率为13.33%,PDCoV/猪流行性腹泻病毒混合感染率为5.95%。基因测序显示PDCoV/CHGD/2016全基因组长度为25 419 bp。全基因同源性分析显示PDCoV/CHGD/2016与3个中国病毒株(PDCoV/CHJXNI2/2015、CHN-JS-2014、CHN-HB-2014)的同源性最高,达99.4%,与两个泰国病毒株的同源率最低,为97.4%;S蛋白氨基酸同源性分析显示,PDCoV/CHGD/2016与其它PDCoV株间的同源率为95.9%～99.3%,其中与PDCoV/CHJXNI2/2015同源率最高,与泰国株的同源性最低。全基因组序列和S蛋白氨基酸序列系统进化树结果表明,PDCoV/CHGD/2016与PDCoV形成一个小的分支,亲缘关系相近,而与鸟丁型冠状病毒亲缘关系较远。本研究为后续PDCoV的诊断防控、病毒学研究提供参考和数据依据。
- 宋亚兵徐帅飞苏丹萍石坚贺东生
- 关键词：全基因组序列遗传进化
- 猪流行性腹泻病毒SC-2014株的分离鉴定及繁殖条件的优化被引量：2
- 2016年
- 从四川省某猪场疑似病毒性腹泻的发病猪采集部分小肠内容物样品,应用RT-PCR检测得到该病料呈PEDV阳性,命名为SC-2014株,将其在Vero细胞上进行连续盲传,传至第8代观察到CPE,传至30代基本能够在Vero细胞上稳定增殖。并通过分别不同胰酶浓度、不同吸附时间、不同PAPN浓度到培养体系中,将分离的病毒继续繁殖8代,然后分别测定不同条件下病毒的TCID50,结果表明:在胰酶浓度为15μg/mL,吸附时间为1.5 h,添加的PAPN浓度为5μg/mL时,PEDV SC-2014株的病毒滴度为10-5.22,达到最大值,使PEDV SC-2014株的繁殖条件得到一定程度的优化。
- 王飞陈小芬焦臣鹏苏丹萍宋亚兵陈瑞爱贺东生
- 关键词：猪流行性腹泻病毒分离繁殖条件
