邹林 作品数:43 被引量:120 H指数:6 供职机构: 北京市通州区疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 北京市自然科学基金 首都卫生发展科研专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 更多>>
酶联免疫吸附试验与实时荧光聚合酶链反应对A组轮状病毒的检测效果比较 2023年 目的比较酶联免疫吸附试验(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)与实时荧光聚合酶链反应(real-time fluorescent polymerase chain reaction,实时荧光PCR)对A组轮状病毒的检测效果,为后续试验提供参考。方法收集2015—2020年北京市某医院肠道门诊5岁以下腹泻儿童粪便样本,使用ELISA和实时荧光PCR两种方法检测A组轮状病毒,采用GP基因分型方法检测ELISA和实时荧光PCR检测阳性的样本。使用SPSS 20.0软件进行Kappa和Spearman统计分析。结果2015—2020年共采集1412份粪便样本,其中155份ELISA检测阳性,166份实时荧光PCR检测阳性。对实时荧光PCR和ELISA两种方法的检测结果进行Kappa检验,Kappa=0.954>0.75,说明这两种诊断方法检测一致性良好。ELISA法的吸光度A值呈偏态分布,实时荧光PCR法的Ct值类似正态分布,Spearman相关系数r=0.088,P=0.278,Ct值和吸光度A值无相关性。有13份标本两种方法检测结果不一致,仅有1份为ELSIA阳性、实时荧光PCR阴性,12份均为ELSIA阴性、实时荧光PCR阳性,其中,10份有GP分型结果,4份为G2[P4],4份为G9[P8],1份为混合感染G2/9[P4],1份为未分型。结论两种诊断方法定性诊断的一致性良好,但ELISA吸光度A值和实时荧光PCR Ct值无相关性,不能通过任何一种方法结果数值来推断另一种方法的结果数值。基因分型结果提示ELISA阴性、实时荧光PCR阳性的样本可能与G2[P4]型别的毒株与检测抗体的匹配度不是很高有关。 甄博珺 田祎 邹林 高翔 张萍 张靖 张扬 郭晓晨 高志勇关键词:A组轮状病毒 实时荧光PCR 实时荧光PCR检测弯曲菌感染病例的粪便和肛拭子样本 2024年 目的通过对3起弯曲菌暴发事件中粪便和肛拭子样本采用实时荧光PCR和培养法检测结果的比较,为实验室快速有效地应对此类事件奠定基础。方法收集3起弯曲菌感染暴发事件中病例的生物样本;使用过滤培养法进行弯曲菌培养检测,分别使用原始样本、增菌24 h和增菌48 h样本提取DNA进行弯曲菌实时荧光PCR检测;使用Kappa检验对实时荧光PCR检测结果和培养法结果进行一致性分析。结果原始样本、增菌24 h和增菌48 h实时荧光PCR检测灵敏度分别为90.91%、97.22%和100%,特异度分别为75.00%、84.00%和78.95%,与培养法结果一致性分析的Kappa值分别为0.643、0.813和0.785。结论实时荧光PCR检测与培养法结合使用是弯曲菌暴发事件处置的有效实验室检测方法。 邹林 贾楠 张萍 甄博珺 郭晓晨 王芳 冀国强 闫爱霞 康颖 马红梅 李颖关键词:弯曲菌 荧光定量聚合酶链式反应 培养法 腹泻病例 一起疑似产气荚膜梭菌腹泻暴发事件实验室检测分析 被引量:1 2023年 目的分析一起疑似由产气荚膜梭菌导致腹泻暴发事件的实验室检测结果,为产气荚膜梭菌食物中毒实验室检测策略的改进奠定基础。方法采集暴发事件中4例病例肛拭子样本,应用荧光PCR方法检测肛拭子及其增菌液中cpa基因与cpe基因。对肛拭子样本进行产气荚膜梭菌分离培养,对部分分离单菌落进行产气荚膜梭菌毒力基因检测和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型。结果4例病例样本中均检测到cpa基因和cpe基因。从病例1样本中挑取并鉴定为产气荚膜梭菌的18个单菌落中获得1个cpe+菌落,构成比为5.56%(1/18);从病例2样本中挑取并鉴定为产气荚膜梭菌的6个单菌落中获得1个cpe+菌落,构成比为16.7%(1/6);病例3未分离到cpe+菌落,病例4未分离到产气荚膜梭菌。11株产气荚膜梭菌菌株包括A型和C型两种,包含5种PFGE带型,分离自病例1和病例2的cpe+阳性菌株PFGE带型一致。结论本次暴发事件可能由产气荚膜梭菌导致,综合使用各种实验室检测方法可在产气荚膜梭菌诊断标准滞后的情况下协助暴发事件分析。 赵凤玲 高翔 甄博珺 张萍 罗宇馨 王润萍 黄震 李颖 邹林关键词:产气荚膜梭菌 腹泻 多克隆 脉冲场凝胶电泳 毒力基因 北京市通州区食源性疾病监测病例中副溶血弧菌的病原特征分析 被引量:1 2023年 目的了解通州区2015—2021年食源性疾病监测病例中副溶血弧菌的脉冲场凝胶电泳(PFGE)优势带型、耐药情况和毒力基因携带情况,为副溶血弧菌感染防控和治疗提供参考数据。方法对2015—2021年通州区定点监测医院门诊腹泻病例的粪便样本进行副溶血弧菌分离培养,对其进行血清分型、毒力基因检测、PFGE聚类分析及药敏试验。结果2828份粪便标本中检出副溶血弧菌100株,检出率为3.54%,每年7~9月是检出高峰月份。不同年份副溶血弧菌检出率差异具有统计学意义(χ2=53.94,P<0.001)。100株副溶血弧菌中有一株未携带tlh基因,89.00%的菌株携带致病性毒力基因tdh。副溶血弧菌优势血清型为O3∶K6(66/100),其次是O4∶K8(9/100)。98株菌副溶血弧菌(2株降解)PFGE分型结果显示副溶血性弧菌有39个PFGE带型,命名为V1-V39,条带相似度在79.6%~100%之间,基因分布呈高度多态性,V22和V25是通州区副溶血弧菌的优势带型。菌株对头孢唑林的耐药率最高(32.00%),其次是氨苄西林(14.00%)和多黏菌素E(13.00%),对四环素类、氯霉素类、氨基糖苷类、碳青霉烯类四类药物100%敏感。结论通州区2015—2021年食源性疾病监测病例中检出的副溶血弧菌主要是O3∶K6型tdh+-trh-菌株,对头孢唑林,氨苄西林和多黏菌素E耐药。PFGE图谱主要流行菌株带型相似度在93.1%以上,存在暴发风险,食品安全相关部门需做好副溶血弧菌监测及暴发预警工作,预防食源性疾病暴发。 张萍 王梦晗 邹林 甄博珺 张扬 张靖 郭晓晨 高翔关键词:副溶血弧菌 毒力基因 血清分型 脉冲场凝胶电泳 耐药 北京市通州区外环境禽流感病毒的流行分布及基因特征分析 2023年 目的通过对2021—2022年北京市通州区农贸市场的外环境及相关人员标本的禽流感病毒检测结果及基因特征分析,为我市禽流感防控策略提供依据。方法2021—2022年共采集外环境及食品涂抹标本2184例,相关人员咽拭子标本124例。利用实时荧光RT-PCR法对标本进行核酸检测,采用illumina二代测序平台对病毒载量高的阳性标本进行全基因组测序,分析其基因特征。结果实时荧光RT-PCR核酸检测结果显示,外环境及食品涂抹标本检出2例H5N8阳性、78例H7N9阳性、177例H9N2阳性、2例H5N8和H9N2共感染、1例H7N9和H9N2共感染,124例人员标本检测结果均为阴性。对病毒载量高的阳性标本进行全基因组测序分析,1例H5N8病毒的HA基因属于为2.3.4.4分支,HA基因的HA0裂解位点序列为多个连续性碱性氨基酸(REKRRKR/GLF),2例H7N9病毒的HA基因与Yangtza river delta属于同一分支,HA基因的HA0裂解位点序列为多个连续性碱性氨基酸(VPKRKRTAR/GLF),均属于高致病性禽流感病毒。遗传进化树分析提示,H5N8和H7N9的HA基因与国内报道的病毒株亲缘关系较近。结论农贸市场是禽流感病毒分布的主要场所,高致病性及低致病性禽流感病毒同时空交叠感染现状,提示应加强禽流感病毒的监测防控工作及防范知识的宣传。 邹林 高翔 张冲 佟玲 刘肖 马静 杨耀武关键词:禽流感 实时荧光RT-PCR 全基因组测序 提高疾控中心微生物检验室内质量控制工作质量和水平的方法探究 被引量:1 2023年 探究提高疾控中心(CDC)微生物检验室内质量控制质量和水平的方法。方法 选择不同时间段的微生物检验室内样本来作为对象。2021年6月~2021年12月(常规组)中选取400份样本研究,该组采取常规质量控制方案。2022年1月~2022年6月间(研究组)选取400份样本,该组采取强化质控方案。观察和统计两组所收集的微生物检验样本质量问题,深入总结影响到质量的原因,探讨有效解决措施。结果 统计两组微生物检验质量问题,结果显示:常规组检验质量问题发生率9.0%(36/400),研究组1.25%(5/400)。组间比较,明显后者占据突出优势(P<0.05,²=7.780)。对比两组检验质量问题影响因素,最终总结出有人员、操作、样本、仪器、环境等方面的影响,研究组质量问题更少。结论 为提升CDC微生物检验室内质量控制效果,可从人员、仪器、环境等方面强化干预,从而提升工作准确性。 王凤君 邹林关键词:疾控中心 微生物检验 一起基于国家致病菌识别网的志贺菌病暴发事件实验室分析 被引量:5 2020年 目的对基于国家致病菌识别网监测体系的志贺菌病暴发事件进行实验室分析。方法对2019年北京市通州区志贺菌病暴发疫情菌株进行分离和鉴定,结合2015—2019年北京市通州区监测和暴发疫情菌株进行脉冲场凝胶电泳分子分型和药敏试验比对分析。结果28株志贺菌中27株带型相似度≥92.0%,疫情相关菌株带型相似度≥97.1%,说明本地区存在一组亲缘关系接近的志贺菌并以低流行态势存在。所有菌株均为多重耐药菌,2019年宋内志贺菌分离株对庆大霉素耐药与2015—2018年比较差异有统计学意义(χ2=49.907,P<0.001),提示庆大霉素在志贺菌病治疗中应慎重使用。全部菌株对环丙沙星、氯霉素、头孢西丁和亚胺培南均敏感,提示该类药物对志贺菌感染具有较好的治疗效果。结论近年来,通州区流行的痢疾菌株主要为宋内志贺菌,菌株同源性较高,多重耐药情况严重,应利用国家致病菌识别网监测体系加强志贺菌的日常监测和耐药监测。 张萍 李颖 甄博珺 高翔 江南 郑燃燃 张扬 邹林 王建国关键词:脉冲场凝胶电泳 耐药 2017-2018年北京市麻疹疑似病例中发热伴出疹疾病相关病毒检测 被引量:3 2019年 目的对麻疹疑似病例中发热伴出疹疾病进行相关病毒检测,探讨在麻疹消除阶段麻疹疑似病例的病原构成.方法收集北京市2017-2018年406份麻疹疑似病例咽拭子,用实时荧光PCR法进行麻疹病毒、风疹病毒、水痘-带状疱疹病毒、人细小病毒B19、EB病毒、其他肠道病毒等11种病毒核酸检测.结果除肠道病毒71型外的10种病毒均检测到,共145例阳性,总阳性率35.71%.除麻疹病毒和风疹病毒外,检出前3位的是单疱病毒6型(13例,3.20%)、EB病毒(12例,2.96%)和人细小病毒B19(10例,2.46%).其他肠道病毒共21例,阳性率5.17%.麻疹病毒、风疹病毒、水痘-带状疱疹病毒、人细小病毒B19和其他肠道病毒发病以成人为主,EB病毒、单疱病毒6型、柯萨奇A组16型儿童和成人病例比例相似.结论除肠道病毒71型外的10种病毒能引起类似麻疹症状而被临床诊断为麻疹.其他肠道病毒也能引起类似麻疹的全身出疹性疾病,而且比例较高. 陈萌 王怡婷 张朱佳子 邹林 窦相峰 黄芳关键词:麻疹 疑似病例 病毒核酸 引起一起发热疫情的人腺病毒4a型基因特征分析 2020年 目的了解引起一起发热疫情的人腺病毒4a型基因特征。方法2019年10月,北京市通州区某小学出现发热疫情,采集病例的咽拭子标本,提取标本核酸作为模板,利用实时荧光PCR方法检测32种呼吸道病毒和细菌。对于腺病毒检测阳性的标本核酸,利用腺病毒特异性引物扩增3个基因(Fiber、Hexon和Penton)的片段并测序,采用局部序列比对基本检索工具(BLAST)比对序列,进行进化关系分析。结果采集的6份病例标本中,腺病毒全部阳性,其他检测的呼吸道病毒和细菌均为阴性。Fiber、Hexon和Penton基因序列比对结果显示,6份标本中的腺病毒均为4a基因型。进化分析显示,该病毒与近年来美国流行的4a型腺病毒高度同源。结论人腺病毒4a型在北京市可以引起呼吸道发热疫情。 邹林 佟玲 张冲 甄博珺 郗璐 杨艳娜 王艳春 李洪军 张铁钢 高翔 张国峰关键词:人腺病毒 基因型 发热疫情 2022年北京市通州区一起霍乱疫情分离菌株的病原学特征分析 被引量:3 2023年 目的分析2022年北京市通州区一起霍乱弧菌引起的疫情的病原学特征,并与引起通州区过往疫情的菌株进行比对分析。方法用实时荧光PCR方法检测样本中O1/O139群霍乱弧菌的特异性基因,同时按常规法对样本进行菌株的分离培养鉴定;用普通PCR方法检测霍乱弧菌的11种毒力基因;用微量肉汤稀释法进行12种药物的敏感性试验,采用NotⅠ限制性内切酶进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)和聚类分析,基于全基因组序列进行菌株遗传学分析。结果本次疫情共检出5株O1群小川型非产毒霍乱弧菌,所有菌株均携带ompU、toxR、tcpI、tcpA^(EL)、hlyA^(EL)、hlyA^(CL)和rtxC基因,不携带ctxAB基因,5株菌耐药情况一致,均为美罗培南–头孢噻肟–头孢他啶–链霉素–氨苄西林–氨苄西林/舒巴坦6种药物耐药,为多重耐药菌株。PFGE分6种带型Ⅰ~Ⅵ,本次疫情菌株带型为Ⅱ型。与通州区既往检出的菌株相比,与2011年2株产毒O1群小川型霍乱弧菌带型较为接近,耐药情况一致,毒力基因携带情况有所差异,但都携带tcpA^(EL)基因。遗传学分析显示本次疫情菌株为不同于第七次世界大流行菌株的新出现的克隆群。结论通州区流行的O1群霍乱菌株以多重耐药小川型非产毒株为主,PFGE带型分散,本次疫情菌株是新出现的克隆群,以后的霍乱防控工作中应重视此类菌株并制定相应的策略。 张萍 邹林 高翔 杨郝亮 甄博珺 李伟红 郭晓晨 林长缨 李仁清 严寒秋 逄波关键词:O1群霍乱弧菌 毒力基因 脉冲场凝胶电泳 遗传学分析