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张淑波
作品数:
2
被引量:1
H指数:1
供职机构:
中山大学生命科学学院
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发文基金:
广东省科技计划工业攻关项目
国家自然科学基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
赵艳超
中山大学生命科学学院
何淼
中山大学生命科学学院
陈维田
香港理工大学
林强乾
中山大学生命科学学院
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作者
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陈维田
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赵艳超
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张淑波
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林强乾
传媒
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中山大学学报...
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2011
1篇
2010
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甲型流感病毒PB1-PA蛋白作用位点的发现与分析
2011年
基于共进化理论,探究了甲型流感病毒PB1蛋白与PA蛋白上具有共同进化可能性的保守九聚片段(C9MP)。结构信息显示PB1蛋白的第1-15位氨基酸与PA蛋白的第239-716位氨基酸具有相互作用域;对该区域变异分布的分析发现,PA蛋白第670位氨基酸Q所在的C9MP与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V和第13位氨基酸P所在的C9MP在PB1MP1相互作用面上具有最低的共进化值。结合DSSP程序的分析表明,由PA蛋白第670位氨基酸Q与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V与第13位氨基酸P构成的区域可能成为潜在的相互作用位点。
何淼
林强乾
赵艳超
张淑波
陈维田
关键词:
甲型流感病毒
相互作用位点
癌症相关促凋亡蛋白Par-4的信号转导途径预测研究
被引量:1
2010年
利用支持向量机(SVM)技术构建Par-4关联的蛋白质相互作用网络,预测出与Par-4有相互作用的蛋白质82个;这些蛋白质按照功能划分为8大类,主要包括:蛋白激酶、泛素化蛋白酶、死亡受体相关因子、与细胞周期或DNA复制相关蛋白质、调节蛋白质、与疾病相关蛋白质、具有特定结构域结合蛋白质和其他蛋白质等。结合文献挖掘和数据库检索信息,推断出了Par-4的2条可能新的信号转导途径。首次预测到Par-4与一大类泛素化蛋白有密切的关系。研究发现,Par-4与多种蛋白质具有复杂的相互作用,并且,在多个细胞凋亡途径中扮演了重要角色。
赵艳超
张淑波
陈维田
何淼
关键词:
PAR-4
SVM
蛋白质相互作用
信号转导
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