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许帅
作品数:
2
被引量:2
H指数:1
供职机构:
山东农业大学植物保护学院植物病理学系
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发文基金:
国家教育部博士点基金
国家自然科学基金
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相关领域:
农业科学
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合作作者
王莹
山东农业大学植物保护学院植物病...
刘群
山东农业大学植物保护学院植物病...
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山东农业大学植物保护学院植物病...
耿超
山东农业大学植物保护学院植物病...
田延平
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基于全基因组序列的黄瓜绿斑驳花叶病毒重组和系统发育分析
被引量:2
2016年
通过RT-PCR扩增了黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)济南分离物(CGMMV-JN)的基因组片段。序列测定结果表明CGMMV-JN基因组全长6 424核苷酸(nt),5'-和3'-UTR分别为60和176 nt,含有4个ORF,分别编码129 kDa和186 kDa复制酶相关蛋白、29 kDa移动蛋白及17.4 kDa外壳蛋白。CGMMV-JN与另外29个CGMMV分离物全基因组核苷酸序列一致率为90.0%-99.7%。重组分析发现韩国KOM(AF417243)、以色列EC(KF155231)、印度(DQ767631)和我国河北的CHB(KJ658958)4个分离物在RdRp编码区存在重组。系统发育分析结果表明,这些分离物可分成3个组。选择压力分析结果表明cp基因处于正选择,其它基因处于负选择。本文研究的结果为黄瓜绿斑驳花叶病毒的监测及防控提供了理论依据。
许帅
刘群
耿超
王莹
田延平
贾曦
李向东
关键词:
黄瓜绿斑驳花叶病毒
系统发育分析
全基因组序列
基于全基因组序列的黄瓜绿斑驳花叶病毒重组和系统发育分析
通过RT-PCR扩增了黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaicvirus,CGMMV)济南分离物(CGMMV-JN)的基因组片段。序列测定结果表明CGMMV-JN基因组全长6424核苷...
许帅
刘群
耿超
王莹
田延平
李向东
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