张栋
- 作品数:3 被引量:7H指数:2
- 供职机构:河北大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学轻工技术与工程更多>>
- 河北平泉农田土壤放线菌物种多样性筛查被引量:4
- 2014年
- 针对河北平泉县典型的农田土壤类型,采用基于全长16S rDNA序列系统发育分析的免培养技术,并结合放线菌门特异引物的筛查,揭示了土壤中放线菌的物种多样性。构建的放线菌16S rRNA克隆文库中的596个放线菌序列归属于29个属,17个科,12个亚目和2个亚纲,并确定了其优势菌属,其中芽球菌属(Blastococcus)(占放线菌总克隆数的12.75%),类诺卡氏菌属(Nocardioides)(9.39%),节杆菌属(Arthrobacter)(8.72%),小月菌属(Microlunatus)(5.37%),酸土单胞菌属Aciditerrimonas(4.69%),沉积岩杆菌属Ilumatobacter(3.35%)。本文为深入理解放线菌的生态功能,及更深层次的放线菌资源的研究、开发和利用提供宝贵的科学资料和丰富的物种信息资源。
- 张栋张晓瑜汤辉张秀敏张利平
- 关键词:RRNA放线菌克隆文库
- 土壤放线菌分离与16S rDNA系统发育分析被引量:4
- 2014年
- 为探讨燕山山脉土壤中可培养放线菌的物种多样性,建立该区域放线菌资源信息库,采用稀释涂布平板法对燕山山脉的26份土壤样品进行了放线菌的分离纯化,根据菌落表型共分离到1 055株分离物,并随机挑选其中200株进行初步鉴定。首先采用链霉菌属(Streptomyces)的特异引物对分离物DNA进行PCR扩增,从而快速鉴定分离物是否属于链霉菌属,然后对其余的分离物进行16SrDNA序列分析。结果表明,随机挑选的200株放线菌分属于19个属,其中哈马达菌属(Hamadaea)为我国首次报道。16SrDNA系统发育分析结果表明,菌株Y0450-41与哈马达菌属模式种的16SrDNA序列相似性为97.3%,是哈马达菌属的一个潜在新种;菌株Y0371-4与其系统发育关系最近已知种特殊链霉菌(Streptomyces specialis)的16SrDNA序列相似性为95.5%,可能代表着一个潜在的新属。
- 李永欣张栋张晓瑜郭立格张利平
- 关键词:燕山山脉土壤放线菌RDNA
- 燕山山脉放线菌物种多样性分子勘探及数据挖掘
- 本研究采用物种分离法和非可培养物种的分子生态探测的方法,对处于横贯我国中部的生态脆弱带典型地带的燕山山脉放线菌物种多样性现况进行了系统的研究。建立了能反映土壤放线菌真实分布情况的土壤样品宏基因组的最佳提取方法,通过构建1...
- 张栋张秀敏张利平
- 关键词:燕山山脉