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Direct RNA Sequencing表征奶牛乳腺上皮细胞转录组特性的研究: 2023年; 本研究旨在表征奶牛乳腺上皮细胞的转录组特性,为基于乳腺上皮细胞的功能基因组学研究提供参考依据。体外培养奶牛乳腺上皮细胞系(MAC-T),用Nanopre Direct RNA Sequencing(DRS)技术进行了三代转录组测序分析,结合生物信息手段分析转录表达、RNA甲基化修饰和选择性剪切等生物学特征。结果发现,在乳腺上皮细胞中共组装到55140个转录本,其中已知转录本51379个,新发现的转录本3761个。多聚腺苷酸A[poly(A)]分析显示,转录本的表达量与poly(A)尾巴长度呈显著负相关(P<0.0001)。在MEC1和MEC3样本中分别检测到6853个和6343个剪切事件,其中剪切事件发生次数最多的前3位是SE、A5和A3。RNA甲基化修饰检测发现,乳腺上皮细胞中m5C位点数高于m6A位点数,其中这些修饰位点主要分布于CDS区域,其次是5’UTR和3’UTR。本研究表征了乳腺上皮细胞转录本、ploy(A)尾巴长度、可变剪切和RNA甲基化修饰等生物学特性,将为乳腺上皮细胞模型的功能基因组学研究提供有效支撑。; 师志海王文佳王亚州张彬邓廷贤; 关键词：奶牛乳腺上皮细胞转录组

兔洛菲不动杆菌感染病例的诊断被引量：5: 2010年; 兰亚莉郎利敏王亚州王刚; 关键词：不动杆菌属感染病例革兰氏阴性液体培养基

牛诺如病毒和牛环曲病毒双重PCR检测方法的建立及初步应用被引量：6: 2020年; 为建立能同时检测牛诺如病毒(BNoV)和牛环曲病毒(BToV)的方法,根据BNoV和BToV基因组的保守区域设计2对特异性引物,预期特异性扩增BNoV和BToV的片段大小分别为542,698 bp,建立了BNoV和BToV的双重PCR检测方法。特异性检测结果显示,该方法能特异性扩增BNoV和BToV的目的条带,且未扩增出其他犊牛腹泻病原;对BNoV和BToV的最低检出量分别为1.90×10^4,1.86×10^4拷贝/μL。利用该方法对采自河南部分地区的184份犊牛腹泻样品的检测结果显示,BNoV和BToV的阳性检出率分别为11.41%和12.50%,与单一PCR检测结果一致。结果表明,本试验建立的方法对BNoV和BToV的鉴别诊断、混合感染和流行病学调查具有重要的应用价值。; 王文佳徐照学张彬张彬孟红丽王亚州兰亚莉; 关键词：犊牛腹泻双重PCR

动物诺如病毒的研究进展被引量：3: 2019年; 诺如病毒(Norovirus,NoV),为诺瓦克样病毒属,与札幌病毒属、兔病毒属、水疱疹病毒属和纽布病毒属同属杯状病毒科,是引起人及牛、猪、犬、猫、鼠、猴子等多种易感动物罹患急性胃肠炎的重要非细菌性病原之一。该病毒原型株于1972年由美国学者Kapikian用免疫电镜技术从1968年暴发的胃肠炎患者样本中被发现,主要经粪—口途径传播,对人类和动物健康构成一定的威胁。; 师志海孟红丽王亚州张彬徐照学兰亚莉; 关键词：诺如病毒免疫电镜技术易感动物急性胃肠炎动物健康

一种具有快速固定功能的犊牛隔离治疗装置: 本发明公开了一种成本低廉且隔离效果好的能够设置在养殖区域近处的具有快速固定功能的犊牛隔离治疗装置，包括隔离房、隔离单元和风墙系统，隔离房内设置多个用于对患病犊牛进行单独圈养的隔离单元，隔离单元与隔离单元之间形成隔离通道，...; 师志海刘洁兰亚莉王文佳王亚州孟红丽张彬

牛诺如病毒、牛星状病毒和牛环曲病毒多重PCR检测方法的建立及应用被引量：12: 2020年; 为建立能同时检测牛诺如病毒(BNoV)、牛星状病毒(BAstV)和牛环曲病毒(BToV)的方法,根据BNoV、BAstV和BToV基因组的保守区域设计3对特异性引物,预期特异性扩增BNoV、BAstV和BToV的片段大小分别为542,376,698 bp,建立了BNoV、BAstV和BToV的多重PCR检测方法。结果显示,该方法能特异性扩增BNoV、BAstV和BToV的目的条带,且未扩增出其他犊牛腹泻病原;BNoV、BAstV和BToV的最低检测限分别为1.34×10^4,1.06×10^4,1.03×10^4拷贝/μL。对采集自河南省的221份犊牛腹泻样品的检测结果显示,BNoV、BAstV和BToV的检出率分别为9.96%(22/221),18.10%(40/221)和19.00%(42/221)。三者与单一PCR检测结果相一致。结果表明,本试验建立的多重PCR方法可用于BNoV、BAstV和BToV的检测和流行病学调查。; 师志海徐照学徐照学张彬兰亚莉张彬孟红丽王亚州; 关键词：犊牛腹泻

荧光探针PCR检测牛嵴病毒的方法建立被引量：2: 2022年; 牛嵴病毒(bovine kobuvirus,BKoV)是与犊牛腹泻密切相关的病原,试验针对BKoV 3D基因设计特异性引物和探针,建立快速检测BKoV的实验室方法。该方法仅能特异性扩增BKoV,对其他犊牛腹泻病原无扩增,特异性较强;对BKoV质粒标准品的最低检出限为11.0拷贝/μL,灵敏性较强;且组内与组间变异系数均小于2%,重复性较好。对采集自河南省的221份犊牛腹泻临床样本进行检测,BKoV的核酸检出率为9.05%(20/221)。本研究建立的检测方法为BKoV的临床快速检测和流行病学调查提供了有效手段。; 师志海王文佳孟红丽王亚州闫祥洲邱祥琦程燕滑留帅施巧婷徐照学; 关键词：荧光探针

基于RNA-seq鉴定金黄色葡萄球菌和大肠杆菌型乳房炎的关键应答基因: 2024年; 该研究旨在通过转录组测序技术发掘金黄色葡萄球菌和大肠杆菌型奶牛乳房炎相关的关键应答基因,为发掘乳房炎防治有关的生物标志物奠定基础。于体外采用金黄色葡萄球菌处理MAC-T建立了金黄色葡萄球菌乳房炎细胞模型,并进行了转录组测序。同时从公共数据库中收集了9份金黄色葡萄球菌和大肠杆菌处理的乳腺上皮细胞转录组测序样本,结合生物信息分析技术进行了金黄色葡萄球菌和大肠杆菌型乳房炎关键应答基因的发掘。结果发现,乳腺上皮细胞中与金黄色葡萄球菌处理显著关联的差异表达基因有449个,其中上调差异基因有223个,下调差异基因有226个;另有347个差异表达基因与大肠杆菌处理显著关联,其中上调的差异表达基因116个,下调的差异表达基因有231个。功能富集分析发现,金黄色葡萄球菌和大肠杆菌型乳腺上皮细胞中的差异表达基因主要富集到IL-17信号通路。蛋白质互作分析发现,383个金黄色葡萄球菌型乳房炎特异性差异表达基因形成了21个调控网络,其中最大的调控网络包含了67个差异表达基因。另外,281个大肠杆菌乳房炎特异性差异表达基因形成了16个调控网络,其中最大的调控网络包含了33个差异表达基因。利用Cytoscap插件CytoHubba进一步筛选出金黄色葡萄球菌和大肠杆菌型乳房炎的关键应答基因各10个。这些关键应答基因的发掘将为进一步阐明金黄色葡萄球菌和大肠杆菌型乳腺炎的发生发展作用机制奠定基础。; 师志海王文佳刘洁王亚州; 关键词：奶牛乳房炎金黄色葡萄球菌大肠杆菌牛乳腺上皮细胞

便携式粪菌分离移植装置: 本发明公开了一种便携式粪菌分离移植装置，包括粪便收集装置和粪菌分离移植装置，粪便收集袋套装在接便器中，套装的接便器和收便桶之间能够相对转动，同时收便桶的内部设置有筋板，接便器下端为逐渐缩小的收口漏斗,粪菌分离移植装置的顶...; 师志海王文佳王亚州兰亚莉施巧婷王二耀

一种具有快速固定功能的犊牛隔离治疗装置: 本发明公开了一种成本低廉且隔离效果好的能够设置在养殖区域近处的具有快速固定功能的犊牛隔离治疗装置，包括隔离房、隔离单元和风墙系统，隔离房内设置多个用于对患病犊牛进行单独圈养的隔离单元，隔离单元与隔离单元之间形成隔离通道，...; 师志海刘洁兰亚莉王文佳王亚州孟红丽张彬; 文献传递

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王亚州

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