巩珊珊
- 作品数：5 被引量：5H指数：1
- 供职机构：东北林业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金黑龙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 低温胁迫下东北林蛙GS、Akt2基因表达与分析
- 东北林蛙（Rana dybowskii）在我国主要分布于东北地区，该地区处于亚寒带，长达6个月的冬眠期对东北林蛙的生存造成极大的威胁。本实验室前期研究表明东北林蛙在低温状态下机体积累大量葡萄糖作为抗冻保护物质抵御低温伤害...
- 巩珊珊
- 关键词：东北林蛙低温胁迫基因表达
- 东北林蛙AKT2基因全长序列分析及其低温胁迫下的表达变化
- 巩珊珊张宇王静涵徐美瑶柴龙会肖向红
- 东北林蛙PDK1基因的克隆及生物信息学分析
- 2017年
- PDK1是PI3K/Akt信号通路中的一个重要的激酶。在哺乳动物中,PI3K/Akt信号通路是一条保守的通路,通过激活下游的因子对糖代谢、脂肪代谢以及蛋白质代谢,细胞的增殖、分化、凋亡等起调节控制作用。本研究基于东北林蛙转录组数据,从中鉴定出PDK1基因3条Unigene序列,并通过RACE法克隆了PDK1基因的全长cDNA,命名为rdPDK1,其全长为1 990 bp,开放阅读框长1 674 bp,编码557个氨基酸。进行生物信息学分析,推测该基因编码的蛋白质相对分子质量63.7 kD,等电点为7.21。该蛋白第82~344个和443~549个氨基酸是2段保守结构域STKc激酶域和PH调节结构域。同源性分析表明rdPDK1蛋白与HsPDK1蛋白氨基酸序列一致率为79%,相似率为100%;与MmPDK1蛋白氨基酸序列一致率为80%,相似率为100%。本研究结果有望为进一步研究东北林蛙PI3K/Akt信号通路中PDK1基因的特性及功能奠定基础。
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- 关键词：东北林蛙基因克隆生物信息学分析
- 东北林蛙GSK3β基因荧光定量PCR引物筛选体系的建立被引量：3
- 2016年
- 为探究低温条件下东北林蛙(Rana dybowskii)肝脏中GSK3β基因表达量变化,需利用荧光定量PCR(Fluorescence quantitative real-time PCR)对GSK3β基因表达量进行检测,而在此过程中PCR引物的筛选直接影响到检测结果数据的准确性与真实性。本实验以东北林蛙为实验对象,基于本研究组前期获得的东北林蛙转录组数据库,并参考其他物种GSK3β基因,利用Beacon Designer 7软件设计了6对引物,采用逆转录PCR和实时荧光定量PCR技术,筛选出1对GSK3β基因荧光定量PCR引物(F-TCCTACATCTGCTCTCGGTA,R-ACATCTATGCTGGAGGTATAATCA),其扩增效率为E=99.3%、R^2=0.998,可用于东北林蛙GSK3β基因实时表达量的研究。
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- 关键词：GSK3Β荧光定量PCR引物
- 低温胁迫下东北林蛙GLUT1转录表达水平的动态变化被引量：1
- 2016年
- 东北林蛙(Rana dybowskii)主要分布在我国东北部,季节性的低温环境使东北林蛙具有高效的抗冻策略,形成高浓度的葡萄糖保护剂是重要的抗冻机制之一。GLUT1是机体细胞中分布最广泛葡萄糖转运蛋白。本实验采用高通量测序技术获得东北林蛙GLUT1mRNA片段,通过实时荧光定量PCR技术分析低温胁迫下(-1℃)东北林蛙随胁迫时间延长,其肝脏、骨骼肌、心脏、脂肪、皮肤组织中GLUT1转录水平的表达变化。结果发现,肝脏和心脏的GLUT1在低温胁迫24 h达到峰值,分别为对照组的9.17倍和5倍;脂肪体和骨骼肌的GLUT1转录水平于48 h达到峰值,为对照组的7.2倍;GLUT1在皮肤中没有显著变化。结果表明,GLUT1参与东北林蛙低温胁迫下的应激反应,并在形成细胞高浓度葡萄糖方面发挥着重要作用。
- 郭柏宏肖向红巩珊珊张晶钰柴龙会
- 关键词：葡萄糖转运体1冷刺激
