邱丽娟
- 作品数：3 被引量：8H指数：1
- 供职机构：安徽医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 系统性红斑狼疮和原发性干燥综合征的共同基因表达特征和分子机制
- 2022年
- 目的初步探究系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)和原发性干燥综合征(primary Sj9gren’s syndrome,pSS)的共同基因表达特征和分子机制。方法利用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)获取SLE和pSS基因表达数据集,进行加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)和差异表达基因分析(differentially expressed genes,DEGs),初步确认SLE和pSS的共同关键基因和基因表达特征。结果WGCNA和DEGs分析结果都显示SLE和pSS的共同基因主要富集在I型干扰素(interferon,IFN)和病毒免疫相关的通路上(均有P<0.05);分析得到9个关键基因,分别是ISG15、IFIT3、OASL、OAS2、SERPING1、GBP1、DDX60、XAF1和DDX58,其中大部分是I型IFN相关基因。结论研究结果提示SLE和pSS的共同基因表达特征主要与I型IFN和病毒免疫相关基因以及通路有关,这为未来的机制研究提供了一定的参考。
- 凌华云吴玲玲周颖邱丽娟王红薛昱陈慧娟王廷睿王斌
- 关键词：系统性红斑狼疮原发性干燥综合征
- IL-6基因单核苷酸多态性与系统性红斑狼疮的相关性研究被引量：7
- 2014年
- 目的探讨白细胞介素(interleukin,IL)6单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)(rs1800796)与系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)的易感性。方法选取SLE患者666例作为病例组,年龄、性别匹配的569例正常人作为对照组,采用TaqMan基因分型技术检测rs1800796基因型频率。结果 Rs1800796 SNP的基因型(CC,CG和GG)频率和等位基因(C和G)频率在SLE患者和对照间差异均无统计学意义(均有P>0.05)。Rs1800796与SLE临床表现的关联性分析发现,C等位基因频率在伴有浆膜炎的SLE患者中低于不伴有浆膜炎的SLE患者(P=0.019)。但C等位基因频率的分布在是否表现有颧部红斑、盘状红斑、光敏感、口腔溃疡、关节炎及狼疮肾炎的SLE病人间差异均无统计学意义(均有P>0.05)。结论尚未发现IL-6rs1800796在中国汉族人群与SLE遗传易感性有关。Rs1800796 C等位基因可能对SLE病人并发浆膜炎起保护作用。
- 温鹏飞王晓松张敏李蕊邱丽娟倪婧潘海峰叶冬青
- 关键词：白细胞介素6
- 原发性干燥综合征患者唾液腺组织ceRNA调控网络的构建被引量：1
- 2022年
- 目的通过生物信息学方法构建原发性干燥综合征(primary Sjögren’s syndrome,pSS)患者唾液腺组织中的竞争内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络并探讨其发病机制。方法利用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)对pSS患者唾液腺组织中的信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱作差异分析。通过miRcode数据库和3个miRNA数据库(TargetScan、miRDB和miRWalk)获取与pSS有关的靶微小RNA(microRNA,miRNA)和靶mRNA,构建lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA调控网络,对ceRNA网络中差异表达基因(differentially expressed mRNAs,DEmRNAs)进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。结果在ceRNA网络中有214个DEmRNAs。KEGG分析显示DEmRNAs的主要富集信号通路为丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路和腺苷酸活化蛋白激酶(AMP-activated protein kinase,AMPK)信号通路,DEmRNAs中10个枢纽(Hub)基因分别为JUN、CCND1、NRAS、DDX5、KAT2B、VEGFA、SIRT1、CLTA、MCM7和RPS6KA1。结论本研究通过构建ceRNA调控网络,发现网络中DEmRNAs主要富集MAPK和AMPK信号通路,为进一步深入探讨原发性干燥综合征的诊断和治疗提供了新的思路。
- 吴玲玲凌华云周颖邱丽娟王红薛昱陈慧娟王廷睿王斌
- 关键词：原发性干燥综合征信使RNA长链非编码RNA微小RNA
