王丹
- 作品数：37 被引量：73H指数：5
- 供职机构：中国热带农业科学院热带生物技术研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项海南省自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程医药卫生更多>>
- 生物质谱技术研究进展及其在蛋白质组学中的应用被引量：27
- 2015年
- 随着蛋白质组学的快速发展,生物质谱技术在蛋白质组学中的应用不断深入,逐渐成为这一领域的核心技术。为系统揭示生物质谱技术在蛋白质组学中的具体应用,综述了生物质谱仪器的快速发展和其在蛋白质鉴定、翻译后修饰和蛋白质定量分析等方面的应用和研究进展。生物质谱技术的进步加快了蛋白质组学研究的进程,但样品的复杂性和庞大数据的处理是生物质谱技术面临的不可避免的挑战。相信随着生物质谱技术的不断完善和改进,它必将会在蛋白质组学研究中发挥更加重要的作用。
- 杨倩王丹常丽丽孙勇靳翔王旭初
- 关键词：质谱技术蛋白质组学
- 热带盐生植物耐盐关键蛋白和基因的挖掘及功能分析
- 常丽丽易小平彭存智仝征靳翔王丹谢翔吴宗伟郭安平王旭初
- 项目所属科学技术领域：生命科学类基础研究领域。主要研究内容：针对有效利用盐渍化土壤的最终目标，该成果全面而系统地研究盐生模式植物盐芥和热带盐生红树林植物海马齿的耐盐分子机理，构建盐芥和海马齿的耐盐调控模式图。通过对盐芥和...
- 关键词：
- 橡胶树PR107和CATAS8-79中胶乳蛋白的差异分析及磷酸化蛋白的鉴定
- 2022年
- 橡胶树是合成天然橡胶的重要植物。PR107和CATAS8-79是具有不同产排胶性状的2个无性系。在以往的研究中,胶乳中蛋白表达差异被认为是影响天然橡胶合成的关键因子之一。然而,这2个无性系之间与胶乳产量相关的蛋白质图谱尚未明确。本研究采用蛋白质组学方法对这些蛋白质进行鉴定,有助于探讨巴西橡胶树胶乳合成机理。经双向凝胶电泳和质谱鉴定分析,共获得65个差异表达蛋白信息。通过磷酸化蛋白质组分析,在PR107胶乳中鉴定出31个磷酸化蛋白质,含有74个磷酸化氨基酸残基,在CATAS8-79胶乳中鉴定出80个磷酸化蛋白质,含有166个磷酸化氨基酸残基。橡胶延伸因子/小橡胶粒子蛋白(REF/SRPP)家族成员被鉴定为差异表达蛋白和磷酸化修饰蛋白,这些蛋白在调节天然橡胶合成中起着重要作用。pro-hevein和hevamine也表现出不同的磷酸化修饰水平,它们主要在天然橡胶排胶过程中起作用。一种丝氨酸-苏氨酸蛋白磷酸酶激酶的磷酸化和去磷酸化修饰可能在天然橡胶合成中起调节作用。这些结果为天然橡胶生物合成调控机制的研究提供了新的理论依据。
- 王丹徐兵强孙勇彭存智常丽丽仝征
- 关键词：巴西橡胶树
- 蛋白质组学关键技术的优化改进及其在热带作物研究中的应用
- 王旭初郭安平庞永奇黄启星王丹常丽丽孙勇易小平孔华郭运玲
- 该项目通过优化改进已有的BPP蛋白提取方法和传统的考马斯亮蓝染色技术，得到适合于含多酚、多糖类热带作物的蛋白提取方法，并发明一种新的GAP凝胶染色技术，提高了蛋白染色的灵敏度和稳定性。同时针对热带地区高温高湿度的环境条件...
- 关键词：
- 关键词：蛋白质组学品种选育
- 巴西橡胶树REF/SRPP家族基因的克隆及表达分析被引量：5
- 2016年
- 巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)胶乳是天然橡胶的主要来源,橡胶延伸因子(REF)和小橡胶粒子膜蛋白(SRPP)作为胶乳中的两大主要蛋白,被认为参与了橡胶的合成和调控。目前,NCBI蛋白数据库已经登录了巴西橡胶树REF/SRPP家族的6个成员,我们通过研究又获得8个新的REF/SRPP基因家族成员,Hb REF154、Hb REF221、Hb REF296、Hb REF542、Hb SRPP178、Hb SRPP203、Hb SRPP216、Hb SRPP234。这14个成员编码蛋白都具有保守的REF结构域,有两个成员还具有ATP合酶亚基结构域,一个成员具有甲基结合结构域。进化分析显示橡胶树REF/SRPP家族成员与产胶植物REF/SRPP家族成员在进化上较为接近。q PCR分析发现该家族成员都响应割胶刺激表达升高,除Hb REF138外其它成员都响应乙烯处理表达降低。通过shotgun数据分析发现,除Hb REF221外的13个成员都存在于橡胶粒子或C-乳清组分中,Hb REF138、Hb REF154、Hb REF175和Hb REF258主要存在于橡胶粒子中,Hb REF542、Hb SRPP216是橡胶粒子中所特有的,Hb REF296和Hb SRPP200是C乳清中所特有的。该研究结果揭示了REF/SRPP家族成员及其基本的表达特性,为深入研究该家族成员在巴西橡胶树产胶中的具体作用提供了一定的基础。
- 冯伟强仝征靳翔王丹孙勇蒙雪茹王旭初
- 关键词：巴西橡胶树SRPP克隆基因表达
- 一种适用于胰蛋白酶解磷酸化多肽的富集方法
- 本发明公开了一种适用于胰蛋白酶解磷酸化多肽的富集方法，使用TiO<Sub>2</Sub>作为吸附用介质，使用除杂液对吸附后的TiO<Sub>2</Sub>介质进行分次除杂洗脱，使用洗脱液对除杂后的TiO<Sub>2</S...
- 王丹孙勇仝征常丽丽彭存智徐兵强
- 一种通过硅胶柱吸附洗脱快速纯化蛋白的方法
- 本发明公开了一种通过硅胶柱吸附洗脱快速纯化蛋白的方法，涉及生物技术领域。包括以下步骤：S1、目标蛋白的获取；S2、蛋白结合缓冲液的添加；S3、溶胶柱的制备；S4、漂洗液的添加；S5、蛋白洗脱液的添加；S6、检测回收效果。...
- 仝征王丹郑杏梅彭存智常丽丽徐兵强
- 不同聚焦条件对双向电泳中木薯叶片蛋白分离的影响
- 通过比较木薯叶片蛋白双向电泳的等点聚焦条件，找到适合木薯叶片蛋白的聚焦参数。方法：提取木薯成熟叶片蛋白质进行双向电泳，比较不同聚焦条件下双向凝胶图谱的差异，并选取具有代表性的蛋白点进行了质谱鉴定。结果：发现提高等电聚焦条...
- 王海燕王丹王斌田维敏王旭初
- 关键词：木薯叶片蛋白质质谱鉴定双向电泳
- 文献传递
- 黑暗条件下木薯叶绿体比较蛋白质组学初步研究被引量：2
- 2015年
- 以"华南8号"木薯叶绿体为研究材料,采用改进酚抽法提取总蛋白,通过一维和二维电泳,经Image Master分析,得到差异蛋白点进行质谱鉴定。结果表明:改进酚抽法可以从木薯叶绿体中提取高质量总蛋白;获得分离性好、分辨率及重复性较高的双向电泳图谱;比较黑暗条件下1,3,5 d木薯叶绿体的蛋白质表达谱,发现186个差异表达蛋白点;经MALDI-TOF MS质谱鉴定,获得28个差异蛋白,这些蛋白主要参与光合作用、碳固定、能量代谢、脯氨酸代谢、胁迫防御等代谢途径。本研究初步阐述了木薯叶绿体在黑暗条件下的蛋白质组变化,在蛋白质水平上鉴定出部分蛋白质的表达可能受光调控。
- 徐兵强贺庭琪王力敏王丹孙勇王旭初郭安平
- 关键词：暗处理比较蛋白质组学质谱
- 尖孢镰刀菌Six1d启动子的克隆及其在真菌分泌表达载体构建中的应用
- 2023年
- 前期研究中构建的真菌分泌表达载体p74HSP-EGFP可在真菌中表达目标蛋白,在真菌侵染并定殖植物的过程中分泌目标蛋白到植物中,从而验证目的基因的功能,但p74HSP-EGFP载体中驱动目的基因表达的毒素基因(toxin A,ToxA)启动子不是尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f. sp. cubense, Foc)自身的启动子。为能在Foc中更有效地表达其自身基因,本研究从尖孢镰刀菌1号生理小种(Foc1)中克隆到高丰度表达的木质部分泌蛋白基因(secreted in xylem 1d, Six1d)的启动子,来替换p74HSP-EGFP载体中的ToxA启动子,并将新构建的真菌分泌表达载体命名为pSix1d74HSPG。为比较2个分泌载体的表达效率,本研究进一步将p74HSP-EGFP和pSix1d74HSPG载体转化尖孢镰刀菌热带4号生理小种(Foc TR4),获得的转化菌株分别在钾盐液体培养基(KK)中振荡培养5 d后,检测分泌到胞外的EGFP荧光强度和EGFP蛋白的表达量。结果显示,pSix1d74HSPG中Six1d启动子驱动的EGFP表达强度能够达到p74HSP-EGFP中ToxA启动子驱动的1.6~1.7倍,说明pSix1d74HSPG载体可代替p74HSP-EGFP载体在Foc中更高效分泌表达目的蛋白,为香蕉枯萎病抗感病分子机理研究提供重要的实验工具。
- 彭存智常丽丽王丹黄超徐兵强仝征
- 关键词：香蕉枯萎病分泌表达载体
