搜索到422篇“ OPERON“的相关文章
A DnaA-dependent riboswitch for transcription attenuation of the his operon
2023年
Transcription attenuation in response to the availability of a specific amino acid is believed to be controlled by alternative configurations of RNA secondary structures that lead to the arrest of translation or the release of the arrested ribosome from the leader mRNA molecule.In this study,we first report a possible example of the DnaA‐dependent riboswitch for transcription attenuation in Escherichia coli.We show that(i)DnaA regulates the transcription of the structural genes but not that of the leader hisL gene;(ii)DnaA might bind to rDnaA boxes present in the HisL‐SL RNA,and subsequently attenuate the transcription of the operon;(iii)the HisL‐SL RNA and rDnaA boxes are phylogenetically conserved and evolutionarily important;and(iv)the translating ribosome is required for deattenuation of the his operon,whereas tRNA^(His) strengthens attenuation.This mechanism seems to be phylogenetically conserved in Gram‐negative bacteria and evolutionarily important.
Yuan YaoHongwei SunWurihanGegehengGeziKirsten SkarstadLifei FanMorigen
关键词:RIBOSWITCH
Characteristics of staphylococcal cassette chromosome mec and lugdunin operon genes in the complete genome of Staphylococcus lugdunensis
2023年
Staphylococcus lugdunensis(S.lugdunensis)is a coagulase-negative Staphylococcus comprising the normal skin microbiota,primarily colonizing the lower abdomen and extremities.[1]S.lugdunensis has attracted substantial attention in recent years since the discovery of lugdunin by Zipperer et al[2]in 2016.Lugdunin is a secondary metabolite synthesized by non-ribosomal peptide synthetase(NRPS)that inhibits the growth of various grampositive bacteria,including methicillin-resistant S.aureus(MRSA),[2]suggesting its potential as an antibiotic.
Shining FuYusheng ChenKe HuTian QinYukun HeLili ZhaoXinqian MaLi ChenWenyi YuYan YuYu XieYifan WangDonghong YangYu XuZhancheng Gao
关键词:MECABDOMEN
嗜盐四联球菌arc operon多拷贝基因在精氨酸代谢中的作用
2022年
【背景】嗜盐四联球菌(Tetragenococcus halophilus)是一类存在于发酵食品中的耐盐乳酸菌,研究其精氨酸(arginine,Arg)代谢对解析食品发酵过程中氨基甲酸乙酯(ethyl carbamate,EC)前体积累机制和保障食品安全具有重要意义。【目的】研究酱醪来源嗜盐四联球菌精氨酸脱亚氨基(arginine deiminase,ADI)途径的基因构成,揭示这些基因对菌株精氨酸代谢和氨基甲酸乙酯前体瓜氨酸(citrulline,Cit)利用与积累的影响。【方法】采用PCR扩增与测序分析不同菌株的ADI途径基因组成,通过比较ADI途径关键基因转录水平和关键酶活性,探究环境因素对嗜盐四联球菌代谢氨基酸能力的影响及各拷贝基因参与氨基酸代谢的功能。【结果】酱醪来源嗜盐四联球菌基因组中ADI途径基因类型主要有两大类:以菌株R23为代表含有完整arc操纵子(operon)基因且具有最多基因拷贝数;以菌株C3为代表缺失arcA和arcB但含有多拷贝arcB和arcC。基因组中有arcA的菌株才具有利用精氨酸能力,并通过利用精氨酸生成瓜氨酸。体系中精氨酸含量和乙醇与脂肪酸的存在均可影响嗜盐四联球菌利用精氨酸积累中间产物瓜氨酸。当精氨酸含量大于5 g/L或体系中含有乙醇与脂肪酸时,嗜盐四联球菌会利用精氨酸积累中间产物瓜氨酸。脂肪酸和乙醇对ADI途径的3个关键酶均有显著抑制作用,可使精氨酸脱亚氨基酶(arginine deiminase,ADI)、鸟氨酸氨甲酰基转移酶(ornithine transcarbamylase,OTC)和氨甲酰磷酸激酶(carbamate kinase,CK)的活性分别降低41.0%、46.4%和60.0%。嗜盐四联球菌中arcB转录水平分别是其拷贝arcB1和arcB2的10.5倍和29.8倍,arcC的转录水平分别是arcC1、arcC2、arcC3的17.6、20.3、23.9倍,说明arcB和arcC在瓜氨酸代谢中起主要作用。【结论】精氨酸含量和乙醇加脂肪酸是影响嗜盐四联球菌代谢精氨酸能否积累瓜氨酸的关键环境因素。嗜盐四联球菌arc
房峻房峻王博方芳
关键词:瓜氨酸氨基甲酸乙酯
Top(ological-operon) secret behind the long-range transcriptional coupling
2022年
In a recent study published in Nature,Levo et al.reported that paralogous genes separated by long distances are regulated by specialized DNA stretches called tethering elements,which enable their physical associations and co-dependent transcriptional coupling during Drosophila embryogenesis.
Lei ZhangZhibing WuHuasong Lu
关键词:TRANSCRIPTIONALCOUPLING
Master Quorum Sensing Regulator HapR Acts as A Repressor of the Mannitol Phosphotransferase System Operon in Vibrio cholerae被引量:1
2022年
The phosphoenolpyruvate(PEP):carbohydrate phosphotransferase system(PTS)is widely used by bacteria to take up sugars or sugar derivatives;.PTS is usually composed of a histidine protein(HPr),enzyme I(EI),and several enzyme II(EII)proteins,such as EIIA,EIIB,EIIC,and EIID[1].
ZHANG Yi QuanMA Li ZhiGAO YueQIN QinLI JieLOU JingZHANG Miao MiaoXUE Xing FanKAN BiaoGAO He
关键词:SUGAR
分子生物学课程思政教学实践案例——原核生物的基因调控(一)乳糖操纵子被引量:2
2022年
课程思政是思想教育的关键环节,有助提高研学生思想意识形态。分子生物学是一门感性与理性并存的学科,既有逻辑推理又有人生哲理。有效地将课程思政与分子生物学融合是提高学生学习能力、思想意识形态和逻辑推理能力的重要手段。本文以"乳糖操纵子调控机制"教学内容为例,从课堂思政融入教学的整体设计思路、教学内容思政教学点、教学效果和教师感悟等几个方面进行了简要介绍,取得了一定教学效果,希望对其他学科的课程思政融入起到很好的借鉴作用。
李根亮唐玉莲李书孙丽双
关键词:乳糖操纵子分子生物学
河弧菌VfqI-VfqR密度感应系统对VflT6SS2附属基因簇中vgrG操纵子的调控研究被引量:1
2022年
目的探究河弧菌VfqI-VfqR密度感应系统对VflT6SS2附属基因簇hcp-vgrG中vgrG操纵子的调控。方法使用荧光定量反转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测野生株和VfqI-VfqR系统缺失株中vgrG的mRNA水平。利用启动子-lux报告质粒系统检测冷光值,确定vgrG启动子在河弧菌野生株、缺失株、回补株中的活性差异。在大肠埃希菌中,导入VfqR过表达质粒,检测vgrG启动子-lux报告质粒冷光值,确定VfqR可否激活vgrG启动子。结果△vfqI、△vfqR和△vfqI-vfqR缺失株中vgrG mRNA水平和启动子活性均显著低于野生株;在△vfqR中回补VfqR表达质粒pSRvfqR和在△vfqI中分别添加3-oxo-C_(10)-HSL、C_(10)-HSL和3-oxo-C_(12)-HSL AHLs分子均能恢复vgrG启动子活性,并且3种AHLs分子效果大体一致。在大肠埃希菌中过表达VfqR并添加上述3种外源AHLs,对vgrG启动子活性没有影响。结论VfqI-VfqR密度感应系统在启动子水平正性调控vgrG操纵子,并且该调控作用是间接的。
韩雨黄元铭程倩李杰刁保卫梁未丽
关键词:河弧菌密度感应系统转录调控
表皮葡萄球菌胞间黏附素基因操纵子对细菌与真菌混合生物膜相关炎症作用影响的体内研究被引量:2
2021年
目的探讨表皮葡萄球菌胞间黏附素基因(intercellular adhesion,ica)操纵子对气管导管材料表面表皮葡萄球菌与白假丝酵母菌混合生物膜相关炎症作用影响的体内研究。方法取表皮葡萄球菌标准株RP62A(ica操纵子阳性,阳性组)、ATCC12228(ica操纵子阴性,阴性组)制备浓度为1×10^(6)CFU/mL的菌液,分别与相同浓度的白假丝酵母菌标准株ATCC10231菌液按照1∶1比例制备成混合培养菌液后,与气管导管材料片孵育24 h,扫描电镜观察材料表面混合生物膜形成情况。取4~6月龄新西兰兔30只分为两组(n=15),分别于气管旁植入孵育24 h的阳性组及阴性组气管导管材料。于术前及术后1、3、7 d测量两组兔体质量。术后1、3、7 d,采用ELISA检测试剂盒检测血浆中IL-1β、IL-6、TNF-α和单核细胞趋化蛋白1(monocytechemotactic protein 1,MCP-1)水平;术后7 d,扫描电镜观察取出的气管导管材料片表面混合生物膜形成情况,HE染色观察材料周围组织炎症浸润情况,平板菌落计数法观察心脏、肺、肝脏、肾脏细菌感染情况。结果扫描电镜观察示体外孵育24 h后阳性组可见明显混合生物膜结构,阴性组未见混合生物膜形成。体内实验显示两组术前及术后1、3、7 d体质量比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。与阴性组相比,阳性组术后1 d IL-1β及MCP-1水平,术后3、7 d IL-1β、MCP-1、IL-6、TNF-α水平均升高,组间比较差异有统计学意义(P<0.05)。扫描电镜观察示阳性组可见大量表皮葡萄球菌残留以及混合生物膜结构,阴性组见极少量表皮葡萄球菌残留,未见混合生物膜结构。HE染色示两组材料周围组织均可见炎症细胞浸润,其中阳性组中性粒细胞及淋巴细胞浸润较阴性组严重。两组心脏、肝脏细菌感染数量差异无统计学意义(P>0.05),阳性组肺、肾脏细菌感染数量高于阴性组(P<0.05)。结论 ica操纵子在表皮葡萄球菌与白假丝酵母菌混合感染中�
张国婧万子琳王小燕黄云超周友全陈颖雷玉洁乔丽梅
关键词:表皮葡萄球菌白假丝酵母菌
嗜热链球菌dlt操纵子终端亚基stDltD的晶体结构
2021年
细胞表面多聚物的酰基跨膜修饰对增强细菌的致病性至关重要.DltA/B/C/D操纵子介导的脂磷壁酸(LTA)D-丙酰化修饰是革兰氏阳性菌中重要的一类后修饰,其调节膜内外的电荷平衡.DltA/B/C/D操纵子主要由DltA、DltB、DltC和DltD四种蛋白质亚基组成,其催化机制与结构在生物进化中高度保守.DltA/DltC介导的胞内D-丙酰胺的转移机理已有深入的研究,而跨膜O-酰基转移酶DltB和dlt操纵子末端DltD介导的跨膜催化过程并不清楚.本文解析了来源于嗜热链球菌(S.thermophilus)中stDltD膜外结构域2.94?分辨率的晶体三维结构.结构比对分析表明,stDltD是dlt操纵子终端的酰基转移酶,属于SGNH-like家族,stDltD的活性中心,包括4个blocks和催化三联体,都保守存在于多种革兰氏阳性病原菌中.此外,结构叠合分析表明,stDltD催化中心形成的正电荷窝沟正好可以结合一个脂磷壁酸骨架的单体即甘油磷酸分子.在前人的研究基础上,我们提出了一个由Dlt/A/B/C/D操纵子介导跨膜D-丙酰化修饰的工作模型.本研究对进一步阐明DltD的生物学功能以及Dlt/A/B/C/D操纵子酰基跨膜修饰的分子机制具有重要意义.
曾琪田利飞刘晏平闫小雪许文青
关键词:晶体结构
胡萝卜软腐果胶杆菌lux发光菌株的构建和应用被引量:1
2021年
胡萝卜软腐果胶杆菌(Pectobacterium carotovorum)是世界十大植物细菌性病原之一。为了便于观察该病原菌侵染过程以及进行早期活体定量检测,本研究构建了表达luxCDABE基因的胡萝卜软腐果胶杆菌发光菌株。首先构建了含有luxCDABE基因操纵子的重组质粒,然后转入胡萝卜软腐果胶杆菌LMG2404中,命名为LMG2404-LUX。与LMG2404相比,LMG2404-LUX的生长速率、生物膜形成和游动性无明显差异;光信号强度与菌液浓度呈线性相关;在菌适宜生长条件下,光信号不受温度和pH的影响;经过10次继代培养后,光信号强度无明显减弱。LMG2404-LUX接种植物后,其致病性与LMG2404无明显差异,侵染初期的光信号强度与该菌侵染增殖呈线性相关。综上所述,LMG2404-LUX可以用于胡萝卜软腐果胶杆菌的快速定量以及植物体内的活体检测,为该菌的相关研究提供了新的工具。
钟灵坤徐翠虹黄泽铭安千里梁岩
关键词:荧光素酶生物发光软腐病

相关作者

林维平
作品数:20被引量:52H指数:3
供职机构:潍坊医学院
研究主题:大肠杆菌 色氨酸 OPERON TRP 突变
孙同毅
作品数:53被引量:65H指数:5
供职机构:潍坊医学院
研究主题:抗菌肽 中华大蟾蜍 氨基酸序列 编码基因 BG
高志芹
作品数:109被引量:299H指数:9
供职机构:潍坊医学院
研究主题:肝细胞癌 血管生成 细胞生物学 大肠癌 微血管密度
朱玉贤
作品数:140被引量:746H指数:15
供职机构:北京大学
研究主题:棉花 克隆 结核分枝杆菌 核酸疫苗 免疫原性
邵志会
作品数:5被引量:6H指数:1
供职机构:中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
研究主题:SV 抗生素 利福霉素 细菌 调节系统