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生物质谱仪高速数据采集系统设计被引量：1: 2017年; 目的研制一种采样频率为2 GHz的高速数据采集系统,以满足生物质谱仪对飞行时间的精确测量要求。方法采用ALTERA STRATIXⅢ系列FPGA作为主控芯片,配合采样频率可达2 GHz、分辨率为12 bit的高性能ADC芯片,同时外扩512 MB DDR3 SDRAM用于数据缓存,并通过千兆以太网与上位机进行数据交互;此外,在高速数据采集板卡布线和制板时,采用多种方式有效保证信号完整性。结果对数据采集板卡输入250 MHz高频信号进行2 GHz数据采集,并对采样结果进行数据分析,得到高速数据采集系统的SNR为44.6639,ENOB为7.1,满足设计要求。结论基于ADC技术的高速数据采集系统是生物质谱数据测量分析的一种快速可靠的路径和方法。; 王惠梁晓会黄传伟; 关键词：高速数据采集系统 FPGA ADC

转Bt基因大米与相应亲本大米差异蛋白质组学研究被引量：1: 2016年; 目的利用差异蛋白质组学及生物信息学等技术方法,探讨外源Bt基因的导入对大米表达蛋白质组的影响,深化转基因大米在蛋白质组学方面的研究。方法在转基因大米"华恢1号"和亲本大米"明恢63"样品中提取大米总蛋白,通过二维聚丙烯酰胺凝胶电泳(2D-PAGE)实验方法,得到相应的蛋白质组2D-PAGE谱,再选择差异明显的蛋白质点进行质谱鉴定及生物信息学分析。结果对转Bt(cry1Ab/1Ac)基因大米和亲本大米2D-PAGE图谱的蛋白质点进行了对比匹配,识别出明显的差异蛋白质点28个,以亲本大米为参照,转Bt基因大米相对高表达的18个,相对低表达的10个;选择转基因大米凝胶上的差异蛋白质点进行了质谱鉴定和生物信息学检索,发现差异蛋白质主要参与能量代谢,蛋白质合成、氧化还原和应激响应等生物过程。结论转Bt基因"华恢1号"及其亲本大米"明恢63"表达的蛋白质组存在一定差异,但未发现这些差异蛋白质具有抗营养性和致敏性,也未发现新蛋白和毒蛋白的表达。; 程娟献夏晴桑志红毛劼王心正董方霆何昆; 关键词：转基因大米差异蛋白质组学质谱鉴定

基于质谱检测转基因生物外源蛋白质的消化稳定性: 2016年; 基于无标记定量质谱检测技术建立了一种新的转基因生物外源蛋白质消化稳定性评价方法。以牛β-乳球蛋白、牛血清白蛋白和大豆胰蛋白酶抑制剂为标准蛋白质,经模拟人体胃/肠消化液消化后进行凝胶电泳分离,切取目标蛋白质条带进行酶切,提取肽段进行纳升液相色谱-电喷雾串联质谱分析。基于Mascot数据库检索鉴定目标蛋白质。计算各消化时间点蛋白质匹配肽段数与消化前蛋白质匹配肽段数的比值,当比值≤0.50时判断为目标蛋白质在该时间段内已消化。将此方法应用于转基因抗虫水稻"华恢1号"外源蛋白Cry1Ab/1Ac的消化稳定性分析,结果显示在模拟胃液中消化2 min时,比值下降到0.50以下,在模拟肠液中消化15 s后比值下降到0.50以下,表明该蛋白在胃/肠消化液中具有消化不稳定性。; 毛劼孙兴程娟献王心正赵永强王红霞何昆夏晴; 关键词：转基因生物质谱

MALDI-TOF质谱技术鉴定龋病患者唾液中的变异链球菌被引量：6: 2014年; 目的:利用基质辅助激光解吸电离时间飞行质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)鉴定龋病患者唾液中的变异链球菌,为探寻快速、准确鉴定变异链球菌的方法提供依据。方法:研究对象为北京大学口腔医院牙体牙髓科就诊的90名龋病患者,收集受试者的唾液样本,处理后进行MALDI-TOF MS检测,结果导入BioExplorer 1.0软件与标准库比对,分值≥25者鉴定为变异链球菌,<25者鉴定为非变异链球菌。最后将质谱和16S rDNA测序结果进行比对,计算灵敏度和一致率。结果:MALDI-TOF MS鉴定变异链球菌的灵敏度为96.0%,与16S rDNA测序结果的一致率为98.7%。结论:MALDI-TOF MS是一种高通量、快速且操作简便的方法,鉴定变异链球菌的灵敏度和一致率都很高,具有较高的临床应用价值。; 任雯陈峰张翼飞张倩王晓燕刘颖熠袁重阳马庆伟徐韬郑树国; 关键词：唾液

基于GC-TOF/MS技术的转Bt基因大米代谢组学研究被引量：5: 2016年; 基于GC-TOF/MS技术对来源于两个不同产地的转Bt基因及其亲本大米进行了代谢组学研究。从大米样本中共检出774个色谱峰,鉴定出278种代谢产物,包括糖、氨基酸、脂肪酸及有机酸等代谢产物。对转Bt基因及其亲本大米进行主成分分析,结果表明,转Bt基因与亲本大米的代谢组之间无明显差异性,进一步对数据进行偏最小二乘判别分析和方差分析,仅甘油和鼠李糖两种代谢产物浓度在转Bt基因大米及其亲本大米间存在一定差异(分别升高1.55和3.32倍);考察了不同产地对大米代谢组的影响,结果表明武汉和海南两个产地的大米代谢组之间存在明显差异,有15种代谢产物在不同产地的亲本大米之间以及不同产地的转基因大米之间均发生显著变化。应用GC-TOF/MS技术对来源于不同产地的转Bt基因大米及其亲本大米的代谢组进行比较研究,结果表明引入外源Bt基因对实验中的水稻机体内代谢未产生明显影响,产地差异造成的大米间代谢组差异比引入外源Bt基因造成的大米间代谢组差异更为显著。; 程建华桑志红李海静吴胜明夏晴董方霆; 关键词：转基因大米代谢组学

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国家重大科学仪器设备开发专项(2012YQ180117)