张彦苹
- 作品数:11 被引量:131H指数:6
- 供职机构:南京农业大学园艺学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中国博士后科学基金教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 果梅RAPD标记不同电泳指纹比较及扩增产物序列分析被引量:5
- 2010年
- 利用11个碱基引物,在对退火温度等反应条件进行严格优化的基础上,以不同品种果梅为材料,同时利用琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳检测了RAPD扩增产物。结果表明:PAGE电泳检测出的谱带总数量以及多态性谱带的数量分别为204和145,以琼脂糖凝胶检测的为91和58。根据PAGE电泳系统获得的标记信息对16个果梅品种进行聚类分析,表明所有品种都能被很好地区分,并在一定程度上反映了果梅品种的亲缘关系。通过对20个随机挑选的扩增片段进行克隆与测序发现,20个片段都是对应引物的RAPD扩增产物,在不同的16个序列中有4条是编码蛋白的基因片段,说明了RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列,同时可以扩增编码蛋白的基因片段,是对基因组不同区域的随时机扩增,所以能够客观地反映不同果梅品种间的遗传差异。
- 李晓颖宋长年张彦苹王玉娟章镇房经贵
- 关键词:果梅RAPD电泳
- 枇杷RAPD扩增产物的不同电泳检测及其序列特征分析被引量:7
- 2010年
- 为了更好地将RAPD技术应用于枇杷品种资源的鉴定以及遗传基础的研究,在选用11个碱基引物以及严格筛选PCR退火温度的最新RAPD技术优化的基础上,以16个枇杷品种为试验材料,对琼脂糖凝胶以及聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳检测的RAPD PCR扩增产物效果进行比较。结果表明,聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳检测出的总谱带数以及多态性谱带数均高于琼脂糖凝胶。根据两种电泳系统获得的标记信息进行枇杷品种遗传聚类分析,结果表明PAGE电泳的分析结果与枇杷的分类情况更为一致。随机对挑选的38个片段进行克隆与测序,发现37个片段都是对应引物的RAPD扩增产物,其中有6条是编码蛋白的基因片段,说明RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列,而且可以扩增编码蛋白的基因片段,是能够揭示枇杷品种间基因组信息异同的理想的DNA标记技术。
- 张晓莹钱剑林王化坤宋长年张彦苹房经贵
- 关键词:枇杷RAPD琼脂糖凝胶电泳PAGE
- 葡萄卷须及其相关研究被引量:5
- 2013年
- 葡萄卷须是为葡萄攀爬提供支持的营养附属器。葡萄中的卷须是花序的形态同源物,可以看成是潜在的生殖器官。因此开展对葡萄卷须发育机理的研究对于葡萄花发育的调控以及产量的提高具有重要的理论指导意义。为了解卷须的类型及其生长发育研究的进展,本文对目前已报道的研究进行了总结与介绍。
- 张彦苹慕茜李晓鹏王晨宋长年房经贵
- 关键词:葡萄卷须花序激素基因
- 16份石榴RAPD扩增产物的两种电泳方法检测及其序列特征被引量:7
- 2010年
- 本实验以16个石榴品种为实验材料,筛选出10个重复性及多态性均较好的引物进行RAPD分析。分别采用琼脂糖凝胶以及聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳检测方法对PCR扩增结果进行检测并对其结果进行比较,结果显示,两种电泳方式均能得到较为清晰的扩增条带,且两种电泳方式获得的条带总数及多态性条带数均有所不同,琼脂糖凝胶电泳方法共检测出76条带,其中有43条为多态性谱带,多态性比率为56.4%;而在PAGE电泳方法共检测出123条谱带,多态性谱带数为87条,多态性比率为70.95%。PAGE电泳方法检测出的条带数约为琼脂糖凝胶电泳方法检测出条带数的1.5倍。基于两种电泳方法所得RAPD标记的多态性位点,利用NYSYS软件计算遗传相似系数,并构建遗传关系聚类图,分析结果显示,石榴遗传多样性丰富,两种电泳方法所得聚类结果大致相同,可以利用RAPD分子标记及两种电泳检测方法对不同数量的石榴进行分子水平的品种鉴定和遗传多样性的分析。同时通过对来自几个引物随机挑选的17个片段进行克隆,测序结果显示17个片段都是对应引物的RAPD扩增产物,其中有3条是编码蛋白的基因片段,表明了RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列,同时也可以扩增编码蛋白的基因片段,这为更好地认识RAPD技术的实质以及促进石榴产业的发展提供了理论依据。
- 张彦苹曹尚银初建青薛华柏王文艳房经贵
- 关键词:石榴RAPDPAGE
- 我国葡萄育种研究概况被引量:36
- 2012年
- 介绍了我国近60年来育成的优良葡萄品种的基本情况,分析了这些葡萄品种的选育方法、亲本来源类型及其利用等,展望了今后葡萄育种的方向。
- 陶然王晨房经贵上官凌飞冷翔鹏张彦苹
- 关键词:葡萄育种方法亲本育种效果
- 石榴RAPD扩增产物的不同电泳检测及其序列分析
- 本试验以16个石榴品种为试验材料,筛选出10个重复性及多态性均较好的11个核苷酸的引物进行RAPD分析.对于PCR扩增结果分别用琼脂糖凝胶以及聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)检测方法进行检测并对其结果进行比较,结果显示,两...
- 张彦苹曹尚银初建青薛华柏王文艳房经贵
- 关键词:石榴RAPD电泳
- 桃NAC基因家族生物信息学分析被引量:14
- 2012年
- NAC基因家族是最大的植物特有的转录因子家族之一,因在植物发育和逆境应答过程中起着多样的作用而被广泛关注。为进一步进行桃NAC家族基因鉴定、功能分析等研究提供基础信息,采用生物信息学方法预测了桃NAC基因家族成员数目、在基因组骨架上分布、表达模式、假定蛋白质结构和亚族分类。预测结果显示桃NAC基因家族包含115个假定NAC蛋白质,被分为17个亚族,且与拟南芥中NAC家族基因具有一定的相似性;1个NAC基因分布在11号骨架上,其余分布在1~8号基因组骨架上;对一级结构的分析结果显示桃NAC家族蛋白质分子量和氨基酸数目成正相关,绝大多数是亲水氨基酸,各亚族间等电点没有规律;115个蛋白质的二级结构全部以无规则卷曲为主要构成元件,且它们的三级结构大部分相似。在果皮中表达的NAC家族基因数最多,达到75%;在花芽中表达的NAC家族基因数较少,为1%。
- 张春华上官凌飞俞明亮张彦苹马瑞娟
- 关键词:生物信息学
- 石榴RAPD扩增产物的不同电泳检测及其序列分析
- 本试验以16个石榴品种为试验材料,筛选出10个重复性及多态性均较好的11个核苷酸的引物进行RAPD分析。对于PCR扩增结果分别用琼脂糖凝胶以及聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)检测方法进行检测并对其结果进行比较,结果显示,两...
- 张彦苹曹尚银初建青薛华柏王文艳房经贵
- 关键词:石榴RAPD电泳
- 文献传递
- 基于EST数据库的葡萄成花途径的预测及分析被引量:6
- 2014年
- 以拟南芥成花途径相关基因序列为探针,对葡萄EST数据库进行同源检索筛选,获得相应的同源EST序列,并以葡萄不同发育时期的不同器官cDNA为模板,通过半定量RT-PCR反应研究了葡萄成花途径相关基因的存在与表达情况,对葡萄成花途径的进行了分析与判断。研究发现,葡萄成花途径中的基因在不同器官中的不同时期的时空表达存在强弱的差异。
- 刘丹慕茜李晓鹏刘更森李玉张彦苹房经贵
- 关键词:葡萄EST基因
- 适于葡萄不同组织RNA提取方法的筛选被引量:54
- 2010年
- 比较了CTAB法、改良CTAB法、Trizol法、SDS-苯酚法和改良SDS法5种RNA提取方法提取葡萄叶片、花序、茎尖、卷须和果实组织RNA的效果。并进一步从总RNA中分离出了高质量的低分子量RNA(LMWRNA),建立了葡萄LMWRNA提取的方法。改进后的改良SDS法能够克服果实中RNA提取难度大的问题,能够从果实中提取到质量和产量都很高的RNA。结果表明,改良SDS法适用于葡萄叶片、花序、茎尖、卷须组织中总RNA的提取,改进的改良SDS法是从果实中提得LMWRNA较佳选择。在总RNA提取的基础上建立的葡萄LMWRNA提取方法能够达到研究的要求。
- 张彦苹王晨于华平蔡斌华房经贵
- 关键词:葡萄总RNART-PCR