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王佶: 作品数：28 被引量：112H指数：7; 供职机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所更多>>; 发文基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项国家科技重大专项国家自然科学基金更多>>; 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>

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埃博拉疫情期间孕妇的医护与管理工作: 2017年; 2014-2016年的埃博拉疫情是迄今为止最大的埃博拉病毒病暴发,无论规模还是影响范围都是空前的.孕妇在疫情流行期间所面对的困难是复杂多样的,值得我们深入关注.本综述拟通过总结世界卫生组织在西非疫情暴发期间颁布的准则以及疫区孕妇所遭遇的问题,结合作者自己的实践经验,分析埃博拉病毒病与孕产妇、医务人员、卫生系统以及社会之间的相互影响,为我国疾控与医疗领域的同行提供参考.我国有关部门也应该针对未来可能存在的疫情威胁尽早制定应急预案,确保妇婴保健工作顺利进行.; 王佶刘军马学军; 关键词：怀孕孕妇医疗护理

新型多重PCR检测技术平台的建立及其应用: 马学军王佶毛乃颖申辛欣张益王雷崔爱利张勇逯鹏王春花史伟张蕾张红向星宇于德山; 该项目围绕中国重要传染病发热呼吸道、腹泻、发热伴出疹和脑炎脑膜炎症候群的主要病原体监测及病原谱构成分析和突发疫情病原快速应急筛查中所面临的技术问题，为满足我国省、市不同层次疾控机构对多病原快速检测和筛查技术的迫切需求，建...; 关键词：; 关键词：传染病软件系统

基于一步巢式qPCR法或一步巢式PCR法检测病毒用锁核酸引物及检测试剂盒: 本发明提供了基于一步巢式qPCR法或一步巢式PCR法检测病毒用锁核酸引物及检测试剂盒，属于肠道病毒检测技术领域。所述锁核酸引物包括上游外引物和下游外引物，所述上游外引物和下游外引物中分别标记有2～6个LNA单体。所述锁核...; 马学军王佶张益申辛欣何小周; 文献传递

基于探针导向的重组酶介导的等温扩增法检测SNP位点用探针和试剂盒: 本发明提供了一种基于探针导向的重组酶介导的等温扩增法检测SNP位点用探针和试剂盒，属于SNP位点检测技术领域。所述基于探针导向的重组酶介导的等温扩增法检测SNP位点用探针，所述探针在重组酶介导的等温扩增法用探针的基础上，...; 马学军段素霞王佶张益申辛欣何小周; 文献传递

利用宏基因组纳米孔测序方法检测模拟临床样本中的基孔肯雅病毒和辛德毕斯病毒被引量：3: 2020年; 基于二代测序的宏基因组测序方法(m-NGS)在理论上可以无偏性地检测样品中的所有生物,在感染性疾病的分子诊断领域彰显了突出的作用。但其实验流程复杂,需要操作者具备足够的知识和经验才能获得准确而丰富的诊断信息。因此,需要建立更简单,更快速而且更低成本的宏基因组测序方法,以满足公共卫生实验室的需求。本研究基于MinION建立了宏基因组纳米孔测序(m-NanoS)方法,并成功用于基孔肯雅病毒(CHIKV)和辛德毕斯病毒(SINV)模拟临床样本的检测。将CHIKV和SINV培养物与发热病人咽拭子混合,灭活后提取核酸用于构建m-NanoS文库。MinION共产生了25147条reads,平均质量得分为10.20,平均读长为1334 bp。来自CHIKV和SINV的reads分别有47条和1371条,占总数据量的0.19%和5.45%。CHIKV和SINV的基因组覆盖度分别为99.45%和99.34%,经过拼接获得一致性序列,与参考序列比对的一致性分别为95%和90%。在公共卫生领域,快速地对样本中潜在的全部病原体进行准确鉴定是一个重要又困难的工作,而m-NanoS方法的成功建立无疑为该工作提供了一个有力的诊断工具。; 王佶张瑞卿孙振璐孙振璐陈操陈操董小平; 关键词：基孔肯雅病毒辛德毕斯病毒

应用中断时间序列分析评价高通量测序技术对临床病毒学的影响被引量：1: 2020年; 目的评估全球范围内大规模高通量测序技术的应用对临床病毒学的定量影响。方法分别收集美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information)2000-2018年如下记录:每年新增全基因组病毒记录数量;每年新增病毒发现文章数量;每年新增病毒准种文章数量;每年新增病毒感染基因标志物文章数量。然后应用中断时间序列法分析上述记录的变化趋势。结果自2008年全球测序中心开始从Sanger法转向使用高通量测序技术以来,各记录每年新增数量分别是使用之前的3.755倍,2.760倍,6.195倍以及3.885倍。各记录长期变化趋势如下:全基因组病毒记录数量每年新增1639.991条(P<0.001);病毒发现文章数量每年新增83.091篇(P<0.001);病毒准种文章数量每年新增2.509篇(P<0.001);病毒感染基因标志物基因感染签名文章每年新增30.836篇(P<0.001)。结论2008年全球测序中心开始应用高通量测序技术,测序成本不断降低,使得高通量测序技术在临床病毒学的应用中日益丰富,对临床病毒学的发展产生了积极深远的影响。; 李洋张益于石成何小周杨梦婕王佶金承刚马学军王琦琦; 关键词：高通量测序临床病毒学

2017年5月至12月河北省儿童病毒性脑炎病原学研究被引量：10: 2019年; 目的了解河北省儿童病毒性炎病原学特点。方法随机收集2017年5月2017年12月河北省儿童医院神经内科住院诊断为病毒性脑炎患儿的脑脊液样本399例,采用结合自动化工作站的实时荧光定量PCR方法和Sanger测序方法检测脑脊液中的病毒核酸。运用SPSS21. 0统计分析软件结合临床资料进行分析。不同月份EV引起的脑炎的感染率比较,采用行x列表卡方检验法进行分析。不同病毒引起的脑炎患者的MRI和脑电图阳性率比较采用Fisher确切概率检验法进行分析。不同病毒合并感染阳性率的比较采用Fisher确切概率进行分析。结果399例样本中80例阳性,检出阳性率20.05%,包括肠道病毒(Entervirus, EV ) 22例,甲型流感病毒(Influenza A virus, FluA )4 例,腮腺炎病毒(Mumps virus, MuV )3 例,单纯疱疹 1 型(Herpes simplex virus 1,HSV1)2 例,单纯疱疹 2 型(Herpes simplex virus 2, HSV2) 1 例,EB 病毒(Epstein - Barr virus, EBV ) 4 例,巨细胞病毒(Cytomegalovirus, CMV) 7 例,带状疱疹病毒(Varicella-zoster Virus, VZV) 7 例,腺病毒(Adenovirus,AdV)8例,人疱疹病毒6型(Human herpesvirus 6,HHV6)14例。阳性样本中8例为合并感染,分别为EV 合并 HHV6 3 例,EV 合并乙性脑炎病毒(Japanese encephalitis virus, JEV, HHV2 合并 AdV 1 例,FluA合并HHV6 1例,MuV合并HHV6 1例,HSV1合并VZV 1例。河北省儿童EV病毒性脑炎高发于5月、6月(P = 0.016)。 HHV6病毒脑炎较非HHV6病毒脑炎易合并感染(P = 0.016);不同病毒引起的脑炎患者的MRI和脑电图阳性率均无统计学差异(P>0.05)。结论 EV是河北省儿童病毒性脑炎最常见的病原。FluA引起的脑炎在临床不容被忽视。; 樊涛韩彦洁张瑞卿于盼辉赵莉齐菊菊李鑫娜王瑞欢孙一硕赵剑胡川泽王佶孙素真马学军; 关键词：病毒性脑炎病原谱实时荧光定量PCR

SARS-CoV-2污染的进口冷链产品导致的一起大连本土新冠疫情被引量：5: 2021年; 2020年12月15日,大连市报告了4名码头冷链货物搬运工人SARS-CoV-2核酸检测呈阳性,在此之前,大连市已经连续136天没有报告本土病例。在这次大连COVID-19疫情(简称"大连新冠疫情")中,我们收集了2020年12月15日至2021年1月8日期间大连新冠疫情中全部感染者(83)及部分接触的轮船货物样本,其中确诊病例占61.45%(51/83),无症状感染者占38.55%(32/83)。通过高通量测序,共获得76条SARS-CoV-2全基因组序列,其中72条(86.75%,72/83)来自临床样本,4条来自R国籍A货船上的冷链食品外包装样本。基因组分析数据显示,与武汉参考株(NC;45512)相比,76条全基因组分别存在12~16个核苷酸突变位点,共享12个核苷酸突变位点,符合B.1.1进化分支突变特征。结合病毒基因组学和现场流行病学调查结果综合分析表明,大连新冠疫情是一起由SARS-CoV-2污染的进口冷链产品感染码头工人导致的本土疫情,在传播过程中至少形成了3个病毒代际和3个相对独立的传播链。; 王佶薄志坚薄志坚毛玲玲杨世宏鲁茁壮聂凯赵翔赵翔孙英伟姚文清孙英伟孙海波王越向妮娟王越宋洋马会来陈操马学军; 关键词：冷链基因组学现场流行病学分子流行病学

喀什边境口岸陆运卡车及集装箱污染的新冠病毒基因特征分析被引量：6: 2021年; 新疆维吾尔自治区喀什地区作为我国与中亚和欧洲的重要陆路货运口岸,来往货物运输频繁,引入新型冠状病毒(SARS-CoV-2)风险大,对我国新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情防控造成压力。2020年11月我国新疆维吾尔自治区喀什地区发生输入SARS-CoV-2导致的本土聚集性COVID-19疫情。为明确货物运输载体携带SARS-CoV-2的基因特征以及边境快速物流系统作为SARS-CoV-2传播载体的可能性,本研究对2020年11月6日-2020年11月10日期间在喀什边境口岸货运卡车及运输的集装箱采集的35份SARS-CoV-2核酸阳性样本进行SARS-CoV-2全基因组序列测定和比对分析。结果显示,35份样本ORF1ab基因Ct值的中位数(最小值~最大值)为37.64(28.91~39.81),N基因Ct值的中位数(最小值~最大值)为36.50(26.35~39.30),Reads数匹配率的中位数(最小值~最大值)为51.95%(0.86%~99.31%),病毒载量较低;35份样本中基因组覆盖度达到70%以上的共计18份。基于Pango命名法,18条SARS-CoV-2基因组序列分别属于B.1、B.1.1、B.1.9、B.1.1.220、B.1.153和B.1.465共6个不同的基因型,其中3个基因型(B.1、B.1.1和B.1.153)在喀什边境接壤或邻近的四个国家同期采集的病例样本中也有发现。核苷酸突变位点和系统进化树分析显示,同一个地点采集的样本病毒基因组相似程度高;18条序列中的4条与喀什COVID-19疫情毒株代表序列处在同一个进化分支;其中1条序列与喀什COVID-19疫情毒株基因组存在1个或2个核苷酸突变位点差异,高度同源。本研究证实喀什COVID-19疫情期间边境货运卡车和集装箱存在境外多种基因型病毒的污染,其中存在喀什COVID-19疫情毒株的祖父代病毒,高度提示边境快速物流系统卡车及集装箱作为载体携带SARS-CoV-2病毒入境造成了本土疫情,这些数据为我国边境口岸地区的新冠防控策略制定及后续疫情溯源提供了关键的参考依据。; 冯晔囡崔燕陈志肖郜振国梦遥马鑫赵翔赵俊赵俊聂凯张璇王佶陈媛王佶王希江陈媛许文波陈操王大燕

2021年1月-2021年5月中国大陆入境人群新型冠状病毒的基因型分析被引量：1: 2022年; 为了解输入中国大陆的新型冠状病毒(新冠病毒,SARS-CoV-2)基因组型别和分布特征,本研究收集了采样日期在2021年1月1日至2021年5月31日间239例境外输入中国大陆的SARS-CoV-2核酸检测阳性人员病毒基因组序列,采用Pangolin在线分型平台(https://pangolin.cog-uk.io/)进行SARS-CoV-2基因组分析。结果显示,2021年1月1日至2021年5月31日间,中国大陆23个省份报告了SARS-CoV-2核酸检测阳性人员病毒序列,广东省报送的SARS-CoV-2基因组序列数最多(42.68%),其次为江苏省(12.13%)。有序列报告的病例来自5个大洲的59个国家(或地区),主要以亚洲(55.23%)和非洲(25.10%)为主,居前3位的国家为肯尼亚、菲律宾和阿联酋,均为14例。依据Pango命名法,239例感染者SARS-CoV-2基因组序列可划分为53个基因型,包括4种关切变异株(Variant of Concern,VOC):Alpha(B.1.1.7)、Beta(B.1.351)、Gamma(P.1和P.1.1)和Delta(B.1.617.2),占比分别为31.80%、14.23%、1.26%和9.62%,分别在14、8、2和6个省份监测发现。输入SARS-CoV-2的基因型以Alpha、Beta和Delta变异株为主。广东省监测发现的输入SARS-CoV-2基因型种类最多(36种),且包括4种VOC(Alpha、Beta、Gamma和Delta)和2种曾经定义的关注变异株(Epsilon和Eta)。本研究数据表明,2021年1月1日至2021年5月31日期间输入中国大陆的SARS-CoV-2基因型呈多样性,多个省份监测发现了国际流行变异株VOC,发现时间与占比与同期国际流行趋势相似,多数省份面临着较大的由输入病例引起本土疫情的风险。建议继续加强入境核酸检测阳性人员SARS-CoV-2基因组测序、感染者的隔离管控以及对重要流行变异株的研究,从而为我国新型冠状病毒肺炎疫情的防控和免疫策略的调整提供科学依据。; 冯晔囡赵翔夏影陈志肖聂凯聂凯牛培华王佶王世文许文波韩俊王大燕; 关键词：新型冠状病毒输入病例基因型

王佶

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