刘君彦
- 作品数：7 被引量：16H指数：3
- 供职机构：华南理工大学轻工与食品学院更多>>
- 发文基金：中国博士后科学基金中央高校基本科研业务费专项资金广东省科技计划工业攻关项目更多>>
- 相关领域：轻工技术与工程医药卫生化学工程更多>>
- 基因组De novo组装结合比较RNA-Seq策略在VBNC状态乳杆菌转录组学研究中的应用被引量：3
- 2016年
- 本文应用有参考基因组组装策略对一株提取自啤酒中的乳杆菌的两种生理状态进行转录组学分析。利用基因组测序技术得到此株乳杆菌的全部基因组信息之后,把此株乳杆菌用低温诱导至VBNC状态,对正常状态和VBNC状态乳杆菌提取总RNA。对RNA质量进行验证,将符合要求的RNA进行逆转录形成c DNA,之后进行文库构建和Solexa测序。通过相关指标对测序结果进行评估,之后以此前获得的全基因组序列为对照,进行转录组与基因组的序列比对和基因表的达差异分析。结果显示比对率大于95%,表达上调的基因有21个,表达下降的基因有7个。本文所应用的基因组De novo组装结合比较RNA-Seq策略与常规De novo RNA-Seq策略相比,省却De novo拼接与组装的繁琐步骤,具有更高的准确性,为今后食品微生物在不同生理状态中分子调控机制的研究提供重要基础。
- 徐振波侯玉超刘君彦邓阳张霞李冰李琳
- 关键词：乳杆菌转录组VBNC
- De novo Illumina技术在糖品腐败乳杆菌生物信息库建立中的应用
- 应用De novo Illumina技术对一种未经测序的糖品腐败乳杆菌进行生物信息库的建立,包括全基因组遗传信息的首次获取以及基因功能的生物信息学分析与注释.通过对1株糖品腐败乳杆菌基因组DNA进行提取与纯化,构建符合质...
- 刘君彦李琳李冰邓阳徐振波
- 关键词：DE
- 寡糖的结构鉴定进展
- 主要介绍了寡糖的结构分析方法,并列举了现阶段用核磁共振法、红外光谱法、质谱法等方法对壳聚糖、酶解褐藻胶寡糖、大枣低聚糖、胭脂树低聚糖、小麦麸皮低聚糖、法夫酵母低聚糖、黄精低聚糖等寡糖的结构鉴定进展,并清晰展现了这些寡糖的...
- 刘君彦李琳李冰邓阳徐振波
- 关键词：寡糖核磁共振谱红外光谱
- De novo测序技术在啤酒易感乳杆菌全基因组研究中的应用被引量：2
- 2015年
- 本文应用De novo测序技术对一种未经测序的啤酒易感乳杆菌进行全基因组研究,包括全基因组遗传信息的首次获取以及基因功能的生物信息学分析与注释。通过对1株从啤酒中分离获得的乳杆菌基因组DNA进行提取与纯化,构建了符合质量要求的测序文库,并进行了De novo测序;通过对De novo测序数据进行筛选与质量评价,进一步对筛选后的数据进行了De novo组装与结果评价,最后获得乳杆菌全基因组序列;在获得全基因组序列的基础上,对全基因组序列进行基因预测,并对预测基因进行GO基因功能注释、COG基因功能注释与KEGG生物通路注释,获取了该乳杆菌的基因序列与基因功能信息。该乳杆菌全基因组测序数据与组装结果良好,获得的序列中共有1,824个预测基因,其中分别有545、1,303、120条预测基因有相应的GO、COG、KEGG注释。本研究为该啤酒易感乳杆菌功能基因的研究与生物信息学分析提供了基础数据和技术参考。
- 刘君彦李琳李冰邓阳徐振波
- 关键词：DE
- EMA-PCR法快速检测啤酒中腐败短乳杆菌被引量：4
- 2017年
- 将叠氮溴乙锭(ethidium bromide monoazide,EMA)与聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术相结合,以酒花耐受基因hor C为靶基因,用啤酒腐败短乳杆菌基因组DNA作为模板进行扩增。结果发现,在前处理过程中加入EMA,当终质量浓度小于20μg/m L时,对活的短乳杆菌中靶基因的扩增没有明显抑制作用;而当EMA终质量浓度为1.0μg/m L时可有效抑制10~5 CFU/m L短乳杆菌死细胞的扩增。本实验建立的EMA-PCR检测方法的灵敏度为10~4活细胞/m L酒液样品。验证实验结果表明,在13株乳酸菌中,建立的hor C特异性EMA-PCR能有效检测到其中的全部5株啤酒污染菌,同时可区分这5株菌的活/死细胞混合体系,降低检测过程中的假阳性。
- 马艳琳徐振波刘君彦汪东风邓阳
- 关键词：聚合酶链式反应啤酒腐败菌短乳杆菌
- 群感效应在金黄色葡萄球菌与铜绿假单胞菌群体增殖中的作用被引量：3
- 2020年
- 群感效应(quorum sensing,QS)是指微生物细胞通过感应细胞外信号分子的浓度从而感知菌群密度的大小,并依赖信号分子的浓度来调控基因表达的一种交流机制。金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)与铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)分别是革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌中典型的食源性致病菌,二者的QS系统在不同情况下的群体增殖中表现出竞争和协同作用,与毒素分泌、耐药性及被膜形成相关。本文中,笔者分别介绍了金黄色葡萄球菌和铜绿假单胞菌的群感效应系统,并概述了群感效应在两种微生物群体增殖中的作用,由于多种微生物种间关系调控和交流机制较为复杂,对两种微生物群体增殖特性和相互作用机制有待进一步研究。
- 徐振波刘子奇谢金红刘君彦
- 关键词：金黄色葡萄球菌铜绿假单胞菌食源性致病菌耐药性生物被膜
- VBNC状态啤酒易感乳杆菌的诱导及复苏被引量：4
- 2014年
- 本文研究了一种典型的难培养啤酒易感乳杆菌-耐酸乳杆菌(Lactobacillus acetotolerans)形成"活的但不可培养"(VBNC)的诱导方式,以及从此状态复苏至可培养状态的方法。将培养至对数期的耐酸乳杆菌2011-11菌株采用啤酒内连续传代驯化法还原其在啤酒酿造过程中的实际生存状况,并通过荧光染料染色对诱导后的耐酸乳杆菌细胞进行活性检测;利用逐步升温和添加促进物法对VBNC菌进行复苏试验。当连续传代至第19代,MRS检测平板上可培养菌数降为零,此时菌体多数仍存在呈现绿色荧光的活细胞,表明耐酸乳杆菌已形成VBNC状态,且仍具有污染啤酒能力;将刚进入VBNC状态的耐酸乳杆菌菌悬液经过氧化氢酶处理后涂布于MRS平板,于26℃厌氧培养,可使耐酸乳杆菌复苏至可培养状态。本研究证实,可通过啤酒内连续传代诱导获得VBNC状态耐酸乳杆菌,而添加过氧化氢酶改良常规MRS平板是一种有效的复苏方法。
- 邓阳刘君彦房慧婧陈江李惠萍李琳涂京霞刘静冯智坚
- 关键词：过氧化氢酶
