本研究通过特异性引物PCR、ERIC-PCR指纹图谱,从一健康人体肠道内筛选到20种ERIC类型的分离物。选取不同ERIC类型的代表菌株进行16S r RNA全长基因测序并在NCBI中进行BLAST,发现15种代表菌株的16S r RNA基因序列与库中的普拉梭菌（Faecalibacterium prausnitzii）相似性均达到97%以上,初步将这些代表菌株鉴定为普拉梭菌。为了筛选出与人体健康具有密切相关性且生物学活性强的优良菌株,通过综合分析15种ERIC类型的分离物的分离丰度及遗传距离,从鉴定出的15株代表菌株中挑选了7株候选优良菌株,进行胆汁酸盐耐受、丁酸盐产生和对肠屏障功能的障影响等评价。研究表明：胆汁酸盐浓度高于0.1%时,F18、F22、F109和F139菌株仍然可以生长,表现出较强的耐胆汁酸能力;菌株间产丁酸盐能力差异显著,F31的丁酸盐产量最高,其次为F18、F20、F33和F139,且这4株菌株间产丁酸盐能力无显著差异;菌株F31使肠屏障功能受损,而其他菌株无明显影响。综合实验数据,筛选出F18和F139为优良菌株。本研究成功实现了普拉梭菌的分离鉴定及优良菌株筛选,为后续的体内实验研究提供了重要研究基础。
本研究利用志贺氏菌显色培养基和ERIC-PCR指纹图谱技术,从一名重度肥胖患者肠道内分离出19种不同ERIC类型的分离物。选取不同ERIC类型的代表菌株进行16S r RNA基因分子鉴定并构建系统发育树,发现19种代表菌株的16S r RNA基因和埃希氏菌属(Escherichia)、志贺氏菌属(Shigella)的相似性达到99%。经生理生化反应鉴定,19种代表菌株均为肠杆菌科的肠埃希氏菌(Escherichia coli)。体外生物学分析发现19种E.coli代表菌株在生化特性、耐药性、毒性方面有明显差异。本研究表明来自一名重度肥胖患者肠道内同一种群的E.coli在菌株水平上具有丰富的微多样性,不同ERIC类型的E.coli在生理生化特性上存在较大的差异,且部分菌株具有潜在致病性。
