王群
- 作品数：76 被引量：105H指数：6
- 供职机构：山东出入境检验检疫局更多>>
- 发文基金：国家质检总局科技计划项目国家科技支撑计划国家质检公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 基于宏基因组学的鸭源样本中坦布苏病毒检测方法的建立
- 2016年
- 利用二代高通量测序技术建立检测鸭源样品中坦布苏病毒的方法。首先将样品过滤和经核酸酶处理,再利用等温链位移扩增(SPIA)技术快速制备样品总cDNA,最后经磁珠纯化和文库构建后,通过Ion Torrent进行高通量测序获得基因组信息。结果显示,通过SPIA扩增和核酸文库制备的优化,可从微量病原样本中获得327pmol/μL的核酸文库样本。Ion Torrent测序共获得1 725 436条reads,约6.2M数据,平均109bp。数据拼接并Blast发现,病原样品的核酸序列可注释鸭坦布苏病毒全部基因组数据,与首次发生在我国的鸭坦布苏病毒BYD-1株参考序列的同源性为100%。将所测病毒序列与其他5种黄病毒科成员进行同源性比对,发现与近3年发生在我国的鸭坦布苏病毒同源性最高,在98%以上。且NS基因进化树分析与鸭坦布苏病毒处于同一分支上,符合鸭坦布苏病毒特征。本研究建立的基于未知病原SPIA扩增结合高通量测序检测方法,可同步获知坦布苏病毒基因的核酸信息。
- 孙涛王超邓明俊郑小龙王群徐彪
- 关键词：宏基因组学
- VHSV病毒样颗粒的制备方法及其应用
- 本发明公开了一种VHSV病毒样颗粒的制备方法及其应用，该病毒样颗粒是由MS2噬菌体编码外壳蛋白包裹VHSV N基因RNA的一种RNA‑蛋白复合体；将编码组氨酸标签序列插入MS2噬菌体编码外壳蛋白的β发夹环结构序列中，构建...
- 王群孙涛岳志芹姜帆梁成珠房保海
- 文献传递
- 东方马脑脊髓炎病毒PCR-DHPLC检测方法的建立与初步应用
- 2016年
- 为建立检测东方马脑脊髓炎病毒(EEEV)的方法,本研究利用PCR结合变性高效液相色谱技术(DHPLC),针对EEEV NS1基因,设计特异性引物,通过优化反应条件,对核酸扩增产物采用DHPLC进行检测分析,核酸扩增产物形成DHPLC特征峰图,建立了EEEV的PCR-DHPLC快速检测方法。结果显示该方法与其他6种常见马病病毒均无交叉反应,未检测到其他马病病毒的阳性吸收峰,具有较强的特异性;对梯度稀释的标准阳性模板的检测限可达到10拷贝/μL;利用本研究建立的方法与荧光定量RT-PCR对30份临床样品进行检测,两者符合率达100%。本研究建立的PCR-DHPLC法具有特异、敏感、快速、重复性好等优点,可以用于EEE的病原学诊断及流行病学调查。
- 郑小龙王群孙涛孙明君张晓文朱来华梁成珠
- 关键词：变性高效液相色谱RT-PCR荧光定量PCR
- 美洲锥虫病——美洲新型艾滋病被引量：2
- 2013年
- 美洲锥虫病,又称查加斯病,是由克氏锥虫引起的潜在致命的寄生虫性人兽共患病。除人外,在美洲200多种哺乳动物感染了克氏锥虫。人和动物感染的主要传播媒介为吸血昆虫——锥蝽,偶尔通过非吸血昆虫媒介机制传播,如输血、污染食品、母婴感染。该病的临床症状因感染阶段不同而异,早期急性期无症状或症状轻微,隐匿期亦无症状,慢性期的典型症状为渐进性慢性心脏和消化系统损害,持续终生,部分病例死亡。因克氏锥虫与人免疫缺陷病毒(HIV)的早期传播模式、漫长的潜伏期和难以治愈等方面极其相似,有专家将查加斯病称为"美洲的新艾滋病"。该病曾局限于美洲地区,但现已随人口迁移传播到欧洲等大陆,成为全球性疫病。在急性期,使用苄硝唑和硝呋替莫抗寄生虫药物治疗很有效;在慢性期,也可延迟或防止症状恶化,但仍有部分慢性病例最终发展成致命的心脏和消化道衰竭。查加斯病可通过病原鉴定、血清学和分子学技术进行诊断。目前尚无查加斯病疫苗,媒介昆虫控制是最有效的预防手段。论文详细介绍了美洲锥虫病的病原学、生活史、流行病学、临床症状、病理变化、诊断、治疗以及防控措施,以供参考。
- 朱来华王宁宁王树峰邓明俊肖西志孙涛魏乃林于红光赵玉然郑小龙王群
- 关键词：克氏锥虫
- HAV病毒样颗粒的制备方法及其应用
- 本发明公开了含有甲肝病毒HAV5’-UTR基因的病毒样颗粒的制备方法。该病毒样颗粒是由MS2噬菌体编码外壳蛋白包裹HAV5’-UTR？RNA的一种RNA-蛋白复合体；将编码组氨酸标签序列插入MS2噬菌体编码外壳蛋白的β发...
- 张晓文房保海孙明君尹伟力岳志芹王群梁成珠王宫璞贾俊涛
- 文献传递
- A型禽流感病毒通用型核酸检测标准样品的研制及不确定度分析
- 利用基因克隆和体外转录技术,制备A型禽流感病毒通用核酸检测阳性标准样品.根据禽流感基质蛋白基因M的序列,设计全长开放阅读框的克隆引物,RT-PCR获得相应片段,连接至PGEM-T载体,测序后采用体外转录方法制备RNA纯品...
- 孙涛雷质文邓明俊王群郑小龙梁成珠曹丙蕾凌宗帅
- 施马伦贝格病毒被引量：1
- 2013年
- 施马伦贝格病毒病(Schmallenberg virus,SBV)是一种新发现的动物传染病,因于2011年底在德国施马伦贝格镇首次发现而临时得名,随后蔓延于西欧(包括比利时、法国、德国、荷兰、意大利、卢森堡、西班牙、英国和丹麦),并分别在奥地利、波兰、瑞典和芬兰等国的牛、山羊、绵羊中检测到抗体。遗传分析显示该病毒与布尼亚病毒科(Bunyaviridae)正布尼亚病毒属(Orthobunyavirus)西姆布血清群病毒(Simbu serogroup viruses)的亲缘关系最密切,西姆布血清群病毒是已知的反刍动物病原,可通过节肢动物媒介(蚊、蠓)传播。施马伦贝格病毒病有2种不同的临床症状:成年牛出现短暂轻微/温和的病症(产奶量减少、发热、腹泻)和新生哺乳动物(牛、羊)死产和先天缺陷。因为同群类似的病毒不是人畜共患病病原,也无该病毒致人发病的证据,但现阶段尚不能完全排除。尽管目前没有特效的药物和疫苗,但因已有类似病毒(赤羽病)的疫苗,疫苗接种应是控制该病的可能选项。因施马伦贝格病毒是一种新发现的病毒,许多方面尚不清楚,还有待于进一步研究。
- 朱来华郑小龙王群肖西志邓明俊魏乃林于红光辛学谦孙涛赵玉然王宫璞
- 关键词：施马伦贝格病毒反刍动物
- 荷斯坦牛瓜氨酸血症焦磷酸测序检测方法的建立与应用被引量：1
- 2014年
- 为建立一种快速高通量的荷斯坦牛瓜氨酸血症(Citrullinemia,CN)分子检测方法,依据CN是由于精氨酸琥珀酸(ASS)合成酶基因编码第86位精氨酸的密码子突变为终止密码子的遗传学基础,利用Assay Design SW软件设计了1对引物和1条测序引物对三种不同基因型的基因材料进行测序分析。用建立的方法对55份进境荷斯坦牛血样进行检测,发现有1例为隐性基因携带者,将PCR产物进行常规测序,结果与焦磷酸测序检测结果一致。研究表明该方法可用于荷斯坦牛瓜氨酸血症的检测,是一种有效的新方法。
- 王群孙涛张晓文郑小龙姜帆赵玉然
- 关键词：瓜氨酸血症荷斯坦牛
- 免疫PCR检测微量H5亚型禽流感病毒被引量：2
- 2011年
- 为了有效检测低浓度禽流感病毒,笔者通过将高特异性的抗原-抗体反应与高灵敏性的PCR扩增技术相结合,建立了一种快速检测痕量H5亚型禽流感病毒的间接免疫PCR方法和间接"三明治"抗体夹心免疫PCR方法。以TopYield 96孔板为固相免疫吸附载体,以禽流感病毒H5蛋白为检测对象,通过一系列免疫反应及亲和素-生物素桥联作用,将生物素标记的报告DNA分子和生物素标记的禽流感病毒H5亚型抗体分子连接。充分洗涤后,在TopYield板孔中添加PCR反应液,对板壁偶联的报告DNA进行PCR扩增,间接达到检测微量禽流感病毒H5蛋白的目标。通过优化报告DNA分子和链亲和素的浓度,2种免疫PCR技术都可检测到约1fg的禽流感病毒H5蛋白,与常规ELISA方法相比,灵敏性提高了近1 000倍。
- 邓明俊肖西志吴振兴张彦明辛学谦郑小龙王群王昌军
- 关键词：免疫PCR禽流感病毒
- 马动脉炎病毒的液相芯片检测引物
- 本发明涉及一种马动脉炎病毒的液相芯片检测引物及检测方法，本发明的检测方法能够对样品进行快速检测，从样品处理到出结果仅需4小时左右；由于采用了接近生物反应体系的液相芯片系统和特异性的探针，使该方法可与荧光定量PCR相媲美。...
- 郑小龙徐彪梁成珠王群朱来华邓明俊岳志芹肖西志赵玉然
- 文献传递
