胡木林
- 作品数：10 被引量：34H指数：4
- 供职机构：中国中医科学院中医临床基础医学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技支撑计划中国中医科学院自主选题项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>
- 用主成分分析探索不同中药组分配伍干预脑缺血的基因表达模式被引量：15
- 2010年
- 目的比较清开灵主要组分黄芩苷、栀子苷及其配伍干预脑缺血损伤的基因表达模式。方法12只4周龄小鼠随机分为黄芩苷组(BA组)、栀子苷组(JA组)、栀子苷+黄芩苷组(BJ组)、尼莫地平组(NM组),建立全脑缺血再灌注小鼠模型后,各组分别给予尾静脉注射黄芩苷、栀子苷、栀子苷+黄芩苷以及尼莫地平。抽提小鼠脑组织的总RNA,制备小鼠全基因组表达谱,对其进行基因本体论功能分类,构建相关系数矩阵,对差异表达的细胞黏附相关基因进行主成分分析。结果获取16463个小鼠脑测全基因组表达谱,筛选出32个差异表达的细胞黏附相关基因。主成分分析结果显示,4组的前2个主成分的累积贡献度为100%,BJ组总得分大于单一组分组,NM组对细胞黏附相关基因干预的总得分高于BA和JA组。各次检测的主成分分布显示,NM组和3个中药组均距离较远,BJ组和BA组的距离均近于JA组。结论黄芩苷、栀子苷及其配伍均能有效干预细胞黏附相关基因,配伍后的干预对黏附相关功能基因的影响大于单一组分组,其基因表达模式和黄芩苷相近。
- 荆志伟周才秀王忠张占军王丽颖胡木林武红莉张亮李澎涛王永炎
- 关键词：栀子苷组分配伍脑缺血细胞黏附
- 基因芯片技术与缺血性脑损伤的基础研究被引量：2
- 2008年
- 荆志伟王忠杨俊红胡木林周才秀高思华王永炎
- 关键词：缺血性脑损伤基因芯片技术脑功能障碍生物技术神经元死亡细胞死亡
- 中医临床个案发表与过程规范的建议
- 王忠王永炎周惠荆志伟李岩梁吉春申春悌陈启光王泓午高颖席宁尤海燕王蕾王燕平胡木林周才秀
- 通过对历史文献的梳理，筛选出符合中医临床个案的报告要点和发表要点，经过专家多次修订后提出了临床个案发表与过程规范建议，从简短摘要，背景介绍，病例一般信息，主诉，病史，诊断，治疗，讨论，专家点评，参考文献等方面明确了个案发...
- 缺血性中风病血瘀证与候选基因SNPs的关联研究
- 目的:探讨AGT基因Met235Thr位点,ApoE基因Cys112Arg和Arg158Cys位点,MTHFR基因C674T位点,TNF-β基因Thr26Asn位点,AT1R基因A1166C位点,eNOS基因Glu298...
- 胡木林
- 关键词：缺血性中风病血瘀证单核苷酸多态性
- 文献传递
- 中风易感性与候选基因SNP位点关联研究被引量：1
- 2008年
- 脑中风是严重危害我国中老年人身体健康的主要疾病之一,对中风相关基因单核苷酸多态性位点在人群中分布情况的研究将有助于深入认识中风发病机制及提高防治能力。该研究用寡核苷酸芯片方法检测了8个多态性位点与中风易感性之间的关联。结果发现:寡核苷酸芯片技术作为一种很好的基因分型方法,具有高通量、平行性、微量化、自动化和快速灵敏等的特点,适用于大规模基因分型平台的建立;实验初步发现与中风易感性相关的有血管紧张素原(AGT)基因M235T(OR=3.437,CI=1.211,9.709),载脂蛋白E(APOE)基因cys158arg (OR=9.434,1.686-83.3),亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T(OR=2.591,1.002-6.711),血管紧张素ⅡⅠ型受体(AT1R)基因A1166C(OR=0.213,0.057-0.799)。
- 张小燕胡木林周才秀王忠陈沁
- 关键词：单核苷酸多态性
- 缺血性中风血瘀证患者MTHFR基因多态性研究被引量：7
- 2009年
- 目的探讨N5,N10亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T多态性与缺血性中风病血瘀证易感性的关系。方法收集缺血性中风病血瘀证患者84例(病例组),缺血性中风病非血瘀证患者143例(对照组),抽外周静脉血提取DNA,采用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)检测MTHFR基因C677T多态性类型。结果2组MTHFR基因C677T基因型频率分布差异有统计学意义(χ2=12.618;d.f.=2,P=0.002),突变型等位基因频率病例组高于对照组(分别为39.29%和24.48%),TT基因型与缺血性中风血瘀证发生显著相关(OR=3.730;95%CI为1.229～11.318;P=0.014)。结论MTHFR基因TT型可能是缺血性中风病血瘀证发病的易感危险因素之一。
- 胡木林王忠李涛张小燕荆志伟周才秀苏莉雅
- 关键词：血瘀证亚甲基四氢叶酸还原酶基因单核苷酸多态性
- 栀子苷、胆酸及其配伍干预脑缺血全基因表达谱的比较研究被引量：5
- 2007年
- 目的比较脑缺血后清开灵主要组分栀子苷、胆酸及其配伍对基因表达谱的影响。方法建立全脑缺血再灌注小鼠模型,分为栀子苷组、胆酸组、栀子苷+胆酸组。一步法抽提小鼠脑组织的总RNA,Cy3/Cy5标记,16463个小鼠脑oligo片段芯片检测全基因组表达谱,每组重复实验669次。Genespring分析显著变化基因,GO原则分类,层次聚类分析全基因组表达谱信息。结果栀子苷组、胆酸组、栀子苷+胆酸组所致差异表达基因数分别为95、86、102,其中上调63、48、56个,下调32、38、45个基因,共同调节基因19个。3组差异基因集中在代谢和信号转导相关基因方面。重叠基因数栀子苷+胆酸组与胆酸组(30个)多于栀子苷+胆酸组与栀子苷组(25个),前两者及早反应基因如Pip92表达相似,后两者则在炎症相关因子,如NFκB、Irf5、IL-1β、TNF-α、IL-6、IFN-γ等表达雷同;聚类分析发现栀子苷组表达谱较胆酸组更接近栀子苷+胆酸组;实时定量PCR结果与芯片结果一致。结论①虽然栀子苷组、胆酸组与栀子苷+胆酸组存在共同的调节基因,但栀子苷组偏重于对炎症相关因子,特别是对NFκB、Irf5等炎症介导因子的调控;而胆酸组对Pip92等凋亡前功能基因的调节较为突出;②重叠基因数与聚类分析结果的不一致提示基因分析不能仅局限在差异数量上,而应该深入分析基因功能和组分的关系。
- 荆志伟张亮王忠张占军胡木林程京李澎涛高思华王永炎
- 关键词：栀子苷胆酸组分配伍脑缺血层次聚类
- 基于微阵列数据构建的基因通路分析软件的研究进展
- 2009年
- 如今生物信息学领域有一个共识,即基因组学和蛋白组学研究产生了爆炸性的微阵列数据,如何利用这些数据构建基因调控网络也成为一个研究热点。文章利用相关的软件平台实现对基因调控网络的构建,并对网络进行分析,在生物信息学、系统生物学、生物医学等领域起着重要的作用。通过综合分析各种软件的特点,有利于帮助研究者根据自己的需要进行合理的选择。
- 周才秀王忠荆志伟谢力胡木林
- 关键词：通路网络可视化
- 亚甲基四氢叶酸还原酶基因C677T、β-纤维蛋白原基因G448A多态性与缺血性卒中遗传易感性的关系被引量：1
- 2009年
- 目的探讨亚甲基四氢叶酸还原酶（methylenetetrahydrofolate reductase，MTHFR）基因C677T、β-纤维蛋白原（β—fibrinogen,β-Fg）基因G448A多态性与缺血性卒中遗传易感性的关系。方法采用寡核苷酸芯片技术对88例缺血性卒中患者及与其配对的88名对照者进行单核苷酸多态性位点检测和分析。结果缺血性卒中患者组MTHFR基因T纯合基因型、杂合基因型和T等位基因频率分别为17．0％、50．0％和42．05％，对照组为11．4％、36．4％和29．55％，两组间MTHFR基因C677T基因型频率（P=0．034）和等位基因频率（P=0．014）分布有显著差异，β—Fg基因杂合基因型和A等位基因频率分别为27．3％和15．91％，对照组为25．0％和14．77％。多元logistic回归分析显示，MTHFR基因C677TCT基因型与缺血性卒中发病有关（优势比为2．181，95％CI1．138～4．181；P〈0．05）；β—Vg基因G448A与缺血性卒中无显著相关性，其与MTHFR基因C677T位点无协同作用。结论MTHFR基因C677T位点突变可能是缺血性卒中发病的遗传因素之一。
- 胡木林李涛陈沁荆志伟王忠
- 关键词：亚甲基四氢叶酸还原酶纤维蛋白原卒中
- 缺血性脑卒中主要候选基因关联分析研究进展
- 2009年
- 脑卒中是一种高致死、高致残的神经系统疾病，已经成为威胁人类健康的主要杀手之一，大约80％的脑卒中是缺血性的。缺血性脑卒中（ischemic stroke，IS）按照TOAST分类法又可分为5种亚型：（1）大动脉粥样硬化型（large—artery atherosclerosis，LAA）；（2）心源性栓塞型（cardiogenic embolism，CE）；（3）小动脉闭塞型（small—artery occlusion，SAA）；
- 胡木林王忠
- 关键词：缺血性脑卒中基因多态性META分析
