李媛睿
- 作品数:24 被引量:161H指数:7
- 供职机构:上海交通大学医学院附属新华医院更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学文化科学更多>>
- 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱在革兰阴性杆菌对β内酰胺类抗生素耐药性检测中的应用进展被引量:7
- 2016年
- β内酰胺类抗生素是一类临床应用最为广泛的抗菌药物,它通过干扰细菌细胞壁肽聚糖的交联结构发挥杀菌作用。该类抗生素包括青霉素及其衍生物、头孢菌素、单酰胺环类和碳青霉烯类等,其中尤以碳青霉烯类抗生素的抗菌活性最强。2013年CHINET细菌耐药性监测数据显示:肠杆菌科细菌对头孢菌素的耐药率约为20%,对碳青霉烯类抗生素的耐药率接近7%;不发酵糖革兰阴性杆菌对头孢菌素和碳青霉烯类抗生素耐药率均接近50%。
- 李媛睿俞静刘瑛
- 关键词:革兰阴性杆菌Β内酰胺类抗生素耐药性
- 分离自儿科患者产NDM-1型碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌的分子流行病学调查
- 目的:了解上海交通大学医学院附属新华医院儿科住院患者产新德里金属-β-内酰胺酶-1(NDM-1)型碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌分离株的分子流行病学特点。方法:收集2013年9月~2016年3月我院儿科住院患者中非重复耐碳青霉烯...
- 李媛睿刘婧娴俞静朱威南刘瑛
- 关键词:儿科患者碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌分子流行病学调查
- 携带blaNDM-1肺炎克雷伯菌的检测及分子流行病学研究
- 论文目的:了解上海新华医院携带blaNDM-1肺炎克雷伯菌的分布情况及分子流行病学特征,初步探讨其传播途径,为预防和控制此类细菌感染提供依据。论文方法:收集2014年1月~ 2016年3月上海交通大学医学院附属新华医院检...
- 李媛睿陈庆刘瑛
- 关键词:肺炎克雷伯菌分子流行病学
- 利用MALDI-TOF MS特异质量峰对耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌同源性的快速分型被引量:12
- 2019年
- 目的利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)筛选耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的特异质量峰,并根据特异质量峰对CRKP进行快速同源性分析。方法选取某院微生物实验室已进行多位点序列分型(MLST)的CRKP 76株,52株用于方法的建立,24株用于方法的验证。设置5个不同的特异峰挑选标准,按照不同的标准筛选各ST型特异质量峰,依据筛选的特异质量峰对CRKP进行分型,将与MLST结果符合率最高的标准确定为最佳标准。依据最佳标准筛选出的特异峰对24株CRKP进行分型,验证特异峰质量分型方法的准确性,并与质谱仪软件中的主成分分析(PCA)和核心图谱(MSP)聚类分析进行比较。结果按照标准2[(1)信噪比(S/N)≥4,(2)S/N比值≥1.5,(3)变异系数(CV)≤40%],52株CRKP中共筛选出45个特异质量峰,利用特异质量峰对29株CRKP进行分型,与MLST符合率最高,达82.8%,确定为最佳标准。按照此标准筛选出的特异质量峰对另外24株CRKP进行分型,与MLST符合率达83.3%。而PCA聚类分析与MLST的符合率仅为66.7%,MSP聚类分析与MLST一致性较差,没有明显符合ST型的分组趋势。结论利用MALDI-TOF MS筛选出不同ST型别CRKP的特异质量峰,可用于CRKP的快速同源性分析,为暴发流行的监测和医院感染的控制提供依据。
- 余佳佳刘婧娴李媛睿刘瑛
- 关键词:多位点序列分型分子流行病学
- MALDI-TOF MS直接快速检测血培养阳性标本中肠杆菌科细菌碳青霉烯酶
- 余佳佳刘瑛刘婧娴李媛睿俞静
- 分离自儿科患者肺炎克雷伯菌的常见碳青霉烯酶基因检测被引量:9
- 2019年
- 目的了解分离自上海交通大学医学院附属新华医院儿科患者耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药机制,为儿科患者CRKP感染的抗菌药物合理使用提供参考。方法收集2010-2016年该院儿科患者临床标本中分离到的非重复CRKP菌株,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)进行菌株鉴定复核。纸片扩散法联合VITEK2-Compact全自动药敏分析系统对实验菌株进行药敏试验。煮沸法提取菌株DNA,PCR及基因测序方法检测KPC、NDM、IMP、VIM、GES、OXA等常见碳青霉烯酶基因。结果儿科患者临床标本中共分离到197株CRKP,主要来自于痰液、尿液、分泌物及血液等标本。197株CRKP对亚胺培南、美罗培南和厄他培南的耐药率分别为93.4%、96.0%和100%,对大多数头孢菌素类抗生素的耐药率达100%,对喹诺酮类的耐药率也较高,但对氨基糖苷类和磺胺类抗菌药物仍保持较高的敏感率。儿科患者CRKP对碳青霉烯类耐药机制主要为产KPC-2酶,其次为NDM-5和NDM-1。共分离到13株携带IMP-4基因和5株携带OXA-232基因的菌株,这些菌株多同时携带2种甚至2种以上耐药基因。该院自2010年在儿科患者中分离到CRKP以来,CRKP在儿科患者中检出率逐年上升,菌株所携带的耐药基因种类也越来越多样化,检出CRKP的患儿分布于11个不同科室,其中以儿科ICU检出率最高。结论分离自儿科患者的CRKP临床菌株耐药程度较高,其携带的碳青霉烯酶基因种类繁多,以KPC-2、NDM-1和NDM-5为主。该院儿科病区,尤其是儿科ICUCRKP流行情况较为严重,应引起重视;需加强感控措施,避免耐药菌株进一步播散流行。
- 刘婧娴李媛睿阿旺穷吉刘瑛
- 关键词:碳青霉烯类肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶儿科
- 儿科患者耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌分离株碳青霉烯酶基因检测
- 论文目的:了解上海交通大学医学院附属新华医院儿科患者耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(Carbapenem resistance Klebsiella pneumoniae, CRKP)分离株碳青霉烯酶基因的分布情况。论文方法:...
- 陈庆李媛睿刘瑛
- 关键词:耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌儿科
- 分离自住院患儿产NDM型碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌分子流行病学调查被引量:3
- 2018年
- 目的了解产新德里金属-β-内酰胺酶(NDM)型碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌(CRKP)分离株的分子流行病学特点。方法收集2013年9月至2016年3月住院患儿的非重复CRKP;采用PCR方法扩增NDM型碳青霉烯酶基因,并对阳性产物进行DNA测序;对产NDM酶菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE),并利用BioNumerics软件进行分型;比较不同型别菌株患儿的临床特征。结果从93株CRKP中检出42株产NDM酶,其中23株产NDM-1酶,19株产NDM-5酶。产NDM酶CRKP分为14个PFGE型别(A型~N型),其中A型、M型和N型为优势型别,占菌株总数69%(29/42),其余11型为非优势型别,占菌株总数31%(13/42)。A型菌株(24%,10/42)均产NDM-1酶,M型菌株(17%,7/42)以产NDM-5酶为主,N型菌株(29%,12/42)均产NDM-5酶,其余11个型别菌株(31%,13/42)以产NDM-1酶为主。优势型别组菌株主要在儿科ICU流行,而非优势型别组菌株在儿科各病区散发分布。优势型别组患儿在入院48小时后发生感染率、留置引流管比例和ICU住院时间均高于非优势型别组患儿,差异有统计学意义(P<0.05);两组患儿的年龄、性别、抗生素使用和预后等的差异均无统计学意义(P>0.05)。结论住院患儿产NDM酶CRKP的碳青霉烯酶类型以NDM-1和NDM-5多见,A型、M型和N型为PFGE优势型别,优势型别在儿科ICU存在小范围播散。
- 李媛睿刘婧娴俞静朱威南刘瑛
- 关键词:碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌分子流行病学
- SDS和SAP前处理联合MALDI-TOF MS在报阳血培养样本快速病原菌鉴定中的价值被引量:4
- 2021年
- 目的评估十二烷基硫酸钠(SDS)和皂甙(SAP)前处理联合基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对报阳血培养样本进行快速病原菌鉴定的应用价值。方法收集2018年4月—2019年4月上海交通大学医学院附属新华医院阳性血培养样本296例,分别采用SDS和SAP对阳性血培养样本进行前处理,获取菌体沉淀后,采用MALDI-TOF MS进行检测,以传统血培养转种培养的鉴定结果为金标准,比较2种前处理方法的病原菌鉴定准确率。结果272例分离出单数菌的阳性血培养样本中,采用SDS和SAP前处理联合MALDI-TOF MS鉴定至种水平的准确率分别为77.2%和70.6%,差异无统计学意义(P=0.079);鉴定到属水平的准确率分别为83.1%和75.7%,差异有统计学意义(P=0.034)。24例分离出2种或2种以上病原菌的血培养样本中,采用SDS和SAP前处理联合MALDI-TOF MS鉴定其中1种细菌至种水平的准确率分别为62.5%和58.3%,差异无统计学意义(P=0.551)。结论SDS和SAP前处理联合MALDI-TOF MS对阳性血培养样本进行鉴定的准确率均较高,可以快速、准确地向临床报告引起血流感染的病原菌种类,可为临床经验抗感染治疗提供参考。SDS作为细胞裂解剂效果略优于SAP。
- 余佳佳李媛睿刘瑛
- 关键词:皂甙基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱血培养病原菌
- 应用MALDI-TOF MS技术快速鉴定布鲁菌被引量:7
- 2018年
- 目的利用MicroflexTMLT型MALDI-TOF质谱仪建立布鲁菌蛋白质量指纹图谱数据库,并评估其在布鲁菌临床分离株鉴定中的应用价值。方法 2013年10月该院微生物实验室分离到1株疑似布鲁菌,经VITEK~2 Compact全自动微生物分析系统及16SrDNA基因测序确认为马耳他布鲁菌,按照厂家推荐方法自建了布鲁菌蛋白质量指纹图谱数据库。对2015年4月及2016年6月该实验室分离到的2株疑似布鲁菌进行革兰染色、柯氏染色及氧化酶、触酶、快速尿素酶等生化反应试验。使用Microflex^(TM)LT型质谱仪收集这2株及外院3株布鲁菌疑似菌株的质量图谱,比对分析图谱时在MALDI Biotyper数据库基础上添加自建数据库,同时使用16SrDNA基因测序法鉴定上述细菌。结果按照自建库推荐操作流程成功获得了基于BRUxh1的自建布鲁菌质量指纹图谱数据库。2015年4月及2016年6月分离到的布鲁菌疑似菌株,涂片染色镜检均为革兰阴性短小球杆菌,氧化酶阳性,触酶阳性,尿素酶阳性(5min内)。这5株疑似菌株的质谱鉴定结果均为布鲁菌(质谱评分分别为2.407、2.475、2.436、2.466、2.397),16SrDNA基因测序确认这5株细菌为布鲁菌。其中来自外院的2株细菌于外院VITEK~2 Compact系统鉴定时均错误地鉴定为吉氏玫瑰单胞菌。结论联合MALDI Biotyper数据库与自建布鲁菌数据库对临床分离株进行质量图谱比对分析,可以实现对布鲁菌属细菌的准确鉴定,该方法快速、灵敏,对布鲁菌病的临床快速诊断具有较高的应用价值。
- 俞静陈峰李媛睿刘瑛
- 关键词:布鲁菌