刘伟兰
- 作品数:5 被引量:6H指数:1
- 供职机构:河北农业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金河北省应用基础研究计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 山羊Agouti基因启动子活性区探究
- 本实验中是在前期拼接获得12847bp的山羊Agouti基因序列(EF587236和JN651404),和对其进行启动子活性区域预测所确定的候选启动子区为6450-7100bp,并预测7100bp处是山羊Agouti基因...
- 刘伟兰
- 关键词:启动子转录因子结合位点瞬时转染
- 文献传递
- 山羊Agouti基因启动子活性区域探究
- 2015年
- 对前期拼接获得的12 847 bp山羊Agouti基因序列(EF587236和JN651404)进行启动子活性区域预测,确定候选启动子区为6 450~7 100 bp,得到一个长度为2 537 bp的DNA片段,在该区域发现一个典型转录因子结合位点TATA框,并预测到HSF,SYR,GATA-1,Nkx-2,ADR1等多个转录因子结合位点;山羊基因组序列(登录号:AJPT01136617.1)中有两段序列与牛的预测启动子promoter A和promoter B同源性较高,据此设计引物扩增目的片段,同时构建12个荧光素酶报告基因质粒,瞬时转染人皮肤黑素瘤细胞A375和293T细胞检测目的片段是否具有Agouti基因启动子活性。结果表明,所构建的目的片段质粒与阴性对照相比无显著差异,说明所获得的目的片段不具有启动子活性。
- 张永改郭敏张大山刘伟兰李祥龙周荣艳李兰会
- 关键词:山羊启动子
- 山羊Agouti基因启动子活动性区探究
- 本实验中是在前期拼接获得12847bp的山羊Agou打基因序列(EF587236和JN651404),和对其进行启动子活性区域预测所确定的候选启动子区为6450-7100bp,并预测7100bp处是山羊Agouti基因的...
- 刘伟兰
- 关键词:启动子转录因子结合位点瞬时转染山羊
- 不同物种TYRP2基因完整编码区生物信息学分析被引量:6
- 2011年
- 应用生物信息学和比较基因组学方法,比较分析了人、毛猩猩、绵羊、牛、猪、马、犬、斑马鱼、大熊猫、小家鼠、褐家鼠、鸭嘴兽、非洲爪蟾、原鸡、绿头鸭、斑胸草雀、黑猩猩、恒河猕猴、狨、灰短尾负鼠和兔21个物种TYRP2基因完整编码区(CDS),并对其遗传多样性、分子系统发育、编码蛋白的氨基酸序列、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、二级结构等进行了预测。结果表明,从21个物种的42条基因序列检测到741个多态位点,共生成26种单倍型。物种间TYRP2基因序列编码区存在较丰富的遗传多样性,物种内该基因序列编码区则存在较强的保守性。TYRP2基因密码子有较强的偏爱性。根据核苷酸歧异度和遗传分化系数对物种的亲缘关系进行分析,结果表明,人与黑猩猩亲缘关系最近,小家鼠和褐家鼠亲缘关系最近。TYRP2基因多肽存在信号肽,有跨膜结构域,表现为疏水性,二级结构的主要组成元件为无规卷曲和α螺旋。
- 刘伟兰李祥龙周荣艳李兰会杨清芳
- 关键词:系统发育
- 山羊PCNP基因启动子的克隆及序列分析
- 2013年
- 对山羊PCNP基因的启动子及其核心调控区进行预测,探讨PCNP基因表达的转录调控特点并分析其特异性转录位点。根据GenBank数据库提供牛的PCNP基因5UTR序列,应用PCR方法从山羊DNA中扩增分离出山羊PCNP基因5UTR片段,将PCR产物克隆入T载体,经琼脂糖凝胶电泳及直接测序鉴定,并对所获得的序列进行生物信息学分析。成功克隆PCNP基因5UTR片段,长度为1 436bp。所得碱基序列与GenBank数据库中牛PCNP基因5UTR同源性为93%。经启动子的生物信息学分析软件分析,推测所得的5UTR为PCNP基因的启动子序列。本试验成功克隆了PCNP基因启动子,为研究PCNP基因的转录调控机制奠定基础。
- 邢增喜贾青刘伟兰陶隽魏星灿胡慧艳
- 关键词:山羊启动子