杨清芳
- 作品数：6 被引量：20H指数：3
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- 不同物种MHC-DRB1基因外显子2生物信息学分析被引量：5
- 2010年
- 为了研究不同物种MHC—DRB1基因的遗传多样性，试验采用比较基因组学和生物信息学方法比较了绵羊、驼鹿、狗、野猪和人的MHC-DRB1基因外显子2序列，并对该基因的遗传多样性及分子系统发育进行了分析。结果表明：在95个基因序列中检测到149个多态位点，共生成83个单倍型。说明物种间及物种内MHC—DRB1基因存在较丰富的遗传多样性。
- 杨清芳李祥龙周荣艳李兰会
- 关键词：物种多态性
- 三个山羊群体微卫星标记的遗传多样性分析
- 利用8个微卫星标记(ILSTS087、BMS1248、BMS574、BMS1678、BMS2508、BM6526、BM1329、GC101)分析了雷州黑山羊、南江黄羊和唐山奶山羊三个山羊群体的分子水平上的遗传多样性;结果...
- 杨清芳李祥龙周荣艳李兰会
- 关键词：山羊微卫星标记遗传多态性杂合度
- 不同物种TYRP2基因完整编码区生物信息学分析被引量：6
- 2011年
- 应用生物信息学和比较基因组学方法,比较分析了人、毛猩猩、绵羊、牛、猪、马、犬、斑马鱼、大熊猫、小家鼠、褐家鼠、鸭嘴兽、非洲爪蟾、原鸡、绿头鸭、斑胸草雀、黑猩猩、恒河猕猴、狨、灰短尾负鼠和兔21个物种TYRP2基因完整编码区(CDS),并对其遗传多样性、分子系统发育、编码蛋白的氨基酸序列、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、二级结构等进行了预测。结果表明,从21个物种的42条基因序列检测到741个多态位点,共生成26种单倍型。物种间TYRP2基因序列编码区存在较丰富的遗传多样性,物种内该基因序列编码区则存在较强的保守性。TYRP2基因密码子有较强的偏爱性。根据核苷酸歧异度和遗传分化系数对物种的亲缘关系进行分析,结果表明,人与黑猩猩亲缘关系最近,小家鼠和褐家鼠亲缘关系最近。TYRP2基因多肽存在信号肽,有跨膜结构域,表现为疏水性,二级结构的主要组成元件为无规卷曲和α螺旋。
- 刘伟兰李祥龙周荣艳李兰会杨清芳
- 关键词：系统发育
- 不同物种Mitf基因编码区生物信息学分析被引量：7
- 2011年
- [目的]对不同物种Mitf基因编码区(CDS)进行生物信息学分析。[方法]采用生物信息学方法分析了小家鼠、褐家鼠、人、黑猩猩、狨、毛猩猩、猕猴、家马、大熊猫、野猪、原鸡和非洲爪蟾Mitf基因编码区的遗传多样性,并对Mitf氨基酸序列、组成成分、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构和结构域进行预测和推断。[结果]在12个物种的37条Mitf基因CDS序列中,共检测到466个多态位点,生成16种单倍型,Mitf基因序列编码区在种内及种间存在丰富的遗传多样性;Mitf蛋白理论等电点均低于7,呈酸性,N端无信号肽,无跨膜结构域,肽链表现为亲水性;蛋白质二级结构的主要元件为α-螺旋和无规则卷曲,有2个保守结构域。[结论]该研究为探明Mitf基因在不同种间和种内的遗传分化,进而为相关黑色素基因的遗传学和进化分析奠定了基础。
- 张丽英李祥龙周荣艳李兰会杨清芳
- 关键词：编码区物种生物信息学
- 五个山羊品种遗传多样性的微卫生分析
- 本研究利用15个微卫星标记,对唐山奶山羊、辽宁绒山羊、南江黄羊、承德无角山羊、雷州黑山羊5个山羊品种共计319个个体的遗传多样性进行了研究。探讨了各品种内的遗传变异及群体间的遗传关系。旨在为山羊遗传资源的合理利用和科学保...
- 杨清芳
- 关键词：山羊养殖基因表达
- 文献传递
- 五个山羊品种遗传多样性的微卫星分析
- 本研究利用15个微卫星标记,对唐山奶山羊、辽宁绒山羊、南江黄羊、承德无角山羊、雷州黑山羊5个山羊品种共计319个个体的遗传多样性进行了研究。探讨了各品种内的遗传变异及群体间的遗传关系。旨在为山羊遗传资源的合理利用和科学保...
- 杨清芳
- 关键词：山羊微卫星聚类分析
- 文献传递
