冯晓旭 作品数:6 被引量:4 H指数:1 供职机构: 中国农业科学院棉花研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
棉花无腺体近等基因系差异表达基因分析 被引量:4 2015年 为了揭示棉花腺体发育的分子机制,本研究利用RNA-Seq对棉花无腺体性状近等基因系Z12/Z12YW的幼嫩叶片进行转录组测序,寻找差异表达基因。转录组测序结果表明,与有腺体棉Z12相比,无腺体棉Z12YW中共有306个基因表达发生变化,其中282个基因下调,24个基因上调。差异表达基因GO(Gene ontology)功能注释显示,细胞组分、胞外基质组分的功能变化以及细胞杀伤生物学过程在腺体形成过程中发挥重要作用;COG(Cluster of orthologous groups)功能和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路显著性富集发现,棉酚等萜烯物质的合成主要受甲羟戊酸途径上游基因的表达调控。此外,本研究共筛选到13个差异表达转录因子,可能在腺体发育和棉酚合成过程中发挥关键作用。 姜鹏飞 陆才瑞 邹长松 程海亮 杨文翠 冯晓旭 张友平 王巧连 宋国立关键词:腺体 近等基因系 转录组 与亚洲棉光籽突变体DPL972中光籽基因紧密连锁的SSR分子标记的开发与应用(英文) 2016年 对棉纤维相关性状基因的克隆及遗传分析可为阐明纤维形成机制奠定良好基础。以野生型材料DPL971及其光籽突变体DPL972为亲本构建F2群体,其中光籽与毛籽性状分离比符合3∶1,表明突变体DPL972中的光籽基因为显性单基因(将其命名为Ga Fzl)。结合棉花基因组数据,合成1567对SSR(Simple sequence repeat)引物,覆盖了A组13条染色体,标记多态性分析和群体连锁分析发现在染色体A08上存在15对与光籽基因Ga Fzl连锁的标记,其中最近的标记为SSR82,遗传距离为6.6 c M。本实验完成了Ga Fzl基因的染色体初步定位,开发了15个与其连锁的SSR标记,为下一步图位克隆奠定了基础。 冯晓旭 邹长松 陆才瑞 程海亮 张友平 Mkulama A P Mtawa 王巧连 宋国立关键词:GA SSR 连锁图 亚洲棉纤维发育时期的转录组分析 棉花纤维是纺织工业中主要的天然纺织原料,棉花纤维和短绒的起始发育研究一直是棉花研究中的热点。本研究对亚洲棉DPL971及其光籽突变体DPL972开花后1、3和5 d的胚珠进行转录组测序并进行差异表达基因(Differen... 冯晓旭 程海亮 左东云 张友平 王巧连 吕丽敏 刘珂 李文倩 刘媛媛 宋国立关键词:棉花 转录组测序 差异表达基因 棉花MYC基因家族鉴定及在色素腺体发育中的表达分析 MYC转录因子在拟南芥中参与植株的发育调控、逆境响应和次生代谢物的合成等。棉花中MYC转录因子也被证实有相似的功能,其中,已经报道了2个MYC转录因子与棉花色素腺体发育相关。本研究对棉花MYC转录因子进行全基因组鉴定,分... 程海亮 左东云 张友平 冯晓旭 吕丽敏 王巧连 宋国立关键词:棉花 色素腺体 MYC 基因表达 与棉花隐性芽黄基因v1紧密连锁的SSR标记及其应用 本发明公开了与棉花隐性芽黄基因v<Sub>1</Sub>紧密连锁的SSR标记及其应用。本发明提供了用于鉴定芽黄棉花的成套引物,所述SSR标记VS2的引物对VS2由序列表序列1和序列2所示的单链DNA组成;所述SSR标记V... 宋国立 张友平 左东云 王巧连 陆才瑞 程海亮 冯晓旭 杨秋红文献传递 与棉花隐性芽黄基因v<Sub>1</Sub>紧密连锁的SSR标记及其应用 本发明公开了与棉花隐性芽黄基因v<Sub>1</Sub>紧密连锁的SSR标记及其应用。本发明提供了用于鉴定芽黄棉花的成套引物,所述SSR标记VS2的引物对VS2由序列表序列1和序列2所示的单链DNA组成;所述SSR标记V... 宋国立 张友平 左东云 王巧连 陆才瑞 程海亮 冯晓旭 杨秋红