肖羽
- 作品数:3 被引量:8H指数:2
- 供职机构:贵州师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:贵州省教育厅自然科学研究项目贵州省国际科技合作计划更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 基于线粒体cytb片段探索小麂新亚种——江口亚种(Muntiacus reevesi jiangkouensis subsp.nov.)的分类地位
- 2011年
- 从保存于贵州师范大学生科院动物标本室的小麂陈旧皮张中提取DNA,利用线粒体DNA细胞色素b通用引物通过PCR扩增,获得小麂江口亚种(Muntiacus reevesi Jiangkouensis subsp.nov.)和小麂指名亚种(Muntiacus reevesi reevesi)的线粒体DNA细胞色素b基因的部分序列,对二者进行序列比对,计算序列差异,并且用最大简约(MP)和贝叶斯(BI)方法构建系统进化树,结果不能确定江口小麂是小麂的新亚种。
- 袁小爱田东朱玉婷肖羽
- 关键词:线粒体CYTB新亚种
- 贵州疣螈D-loop区和tRNA^(Phe)序列变异及群体遗传多样性被引量:3
- 2010年
- 贵州疣螈(Tylototriton kweichowensis)是我国特有的国家Ⅱ级保护动物,分布面积极为狭窄。为了解其遗传多样性现状,作者采获了几乎覆盖其分布范围的12群体的58个体的材料,测定了线粒体D-loop区(mtDNA控制区)及tRNAPhe基因全序列共808bp,发现16个变异位点,定义了26个单元型。遗传多样性检测显示,贵州疣螈种群具有高的单元型多样性和低的核苷酸多样性。Tajima’s D和Fuand Li’s D值检测结果均表明,贵州疣螈种群相对于中性进化的歧异度并没有明显的偏离。系统发育及网络进化分析没有显示出单元型和地理位置的对应关系,各群体的单元型都相互散布在不同的分布群中,呈现一种混杂的分布格局。水城群体与其他任一群体间基因流Nm<1,有分化的迹象。总的来说,贵州疣螈各群体之间没有发生极显著的遗传分化,因此建议将贵州疣螈所有群体作为一个整体管理单元加以保护。
- 肖羽陈光照谷晓明
- 关键词:贵州疣螈D-LOOP区基因流
- 尾斑瘰螈种群的D-loop区遗传多样性分析被引量:6
- 2011年
- 以线粒体DNA D-loop序列为分子标记,研究了采自雷公山和武陵山的尾斑瘰螈(Paramesotriton caudopunclatus)5个种群的遗传多样性。获得42个个体mtDNA D-loop区序列,长度为690 bp,其中有30个变异位点,由此定义了13个单倍型。5个种群中未出现共享单倍型的现象。尾斑瘰螈种群有相对较多的单倍型数(Hd)和较低的核苷酸多样性(Pi)。遗传分化指数(FST)、核苷酸歧异度(Dxy)和基因流(Nm)分析表明,雷公山的3个种群与武陵山的2个种群间有了一定程度分化。从系统进化树来看,各单倍型按照地理分布聚合,雷公山的3个种群构成一支,武陵山的2个种群构成另一支。建议将雷公山种群、武陵山种群分别作为2个不同单元进行保护。
- 陈光照肖羽陈学平谷晓明
- 关键词:尾斑瘰螈地理种群D-LOOP区