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赵柳青
作品数:
2
被引量:3
H指数:1
供职机构:
贵州师范学院化学与生命科学学院
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发文基金:
贵州省科学技术基金
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相关领域:
生物学
理学
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合作作者
罗杰斯
四川大学化学工程学院
陈曼
贵州师范学院化学与生命科学学院
柳凤娟
贵州师范学院化学与生命科学学院
余乐正
贵州师范学院化学与生命科学学院
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不同类型的革兰氏阴性菌分泌系统蛋白分类研究
被引量:1
2015年
革兰氏阴性菌细胞中至少存在八种分泌系统,而每种分泌系统分别由一系列具有特定结构与功能的蛋白质组成。因此,对不同类型的细菌分泌系统蛋白进行深入研究,不仅有助于理解对应的蛋白质分泌机制,对于疾病的诊断与治疗及新药研发也具有重要意义。以氨基酸组成和位置特异性得分矩阵为替代模型,本文构建了一个基于支持向量机构的多元分类器以快速区分不同类型的革兰氏阴性菌分泌系统蛋白。实验结果表明,本方法对I、II及V型分泌系统蛋白具有较好的预测性能。
余乐正
陈曼
赵柳青
罗杰斯
柳凤娟
关键词:
革兰氏阴性菌
支持向量机
基于SVM的革兰氏阴性菌分泌系统蛋白识别方法
被引量:2
2016年
本文提出了一种基于SVM快速识别革兰氏阴性菌分泌系统蛋白的方法.该方法以氨基酸组成和位置特异性得分矩阵为最优特征集,充分考虑了蛋白质的序列信息及进化信息.实验结果表明,本文提出的方法对革兰氏阴性菌分泌系统蛋白具有较好的预测性能,可作为细菌分泌系统研究的有益补充.
余乐正
赵柳青
陈曼
罗杰斯
柳凤娟
关键词:
革兰氏阴性细菌
SVM
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